RETRACTED ARTICLE: KDM4 orchestrates epigenomic remodeling of senescent cells and potentiates the senescence-associated secretory phenotype

衰老 表观遗传学 细胞生物学 生物 癌症研究 间质细胞 染色质 表观遗传学 重编程 脱甲基酶 转录组 下调和上调 肿瘤微环境 组蛋白 表型 DNA甲基化 遗传学 细胞 基因 基因表达 DNA 肿瘤细胞
作者
Boyi Zhang,Qilai Long,Shanshan Wu,Qixia Xu,Shuling Song,Han Liu,Min Qian,Xiaohui Ren,Hanxin Liu,Jing Jiang,Jianming Guo,Xiaoling Zhang,Xing Chang,Qiang Fu,Eric W.‐F. Lam,Judith Campisi,James L. Kirkland,Yu Sun
出处
期刊:Nature Aging 卷期号:1 (5): 454-472 被引量:54
标识
DOI:10.1038/s43587-021-00063-1
摘要

Cellular senescence restrains the expansion of neoplastic cells through several layers of regulation. We report that the histone H3-specific demethylase KDM4 is expressed as human stromal cells undergo senescence. In clinical oncology, upregulated KDM4 and diminished H3K9/H3K36 methylation correlate with poorer survival of patients with prostate cancer after chemotherapy. Global chromatin accessibility mapping via assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing, and expression profiling through RNA sequencing, reveal global changes of chromatin openness and spatiotemporal reprogramming of the transcriptomic landscape, which underlie the senescence-associated secretory phenotype (SASP). Selective targeting of KDM4 dampens the SASP of senescent stromal cells, promotes cancer cell apoptosis in the treatment-damaged tumor microenvironment and prolongs survival of experimental animals. Our study supports dynamic changes of H3K9/H3K36 methylation during senescence, identifies an unusually permissive chromatin state and unmasks KDM4 as a key SASP modulator. KDM4 targeting presents a new therapeutic avenue to manipulate cellular senescence and limit its contribution to age-related pathologies, including cancer. Senescent cells and their production of inflammatory cytokines (senescence-associated secretory phenotype) affects aging and disease, including cancer. Zhang et al. report that epigenomic remodeling by KDM4 controls the senescence-associated secretory phenotype, and KDM4 expression by stromal cells of the tumor microenvironment promotes prostate cancer.
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