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Systematic Study of the Glutathione Reactivity of N-Phenylacrylamides: 2. Effects of Acrylamide Substitution

化学 取代基 丙烯酰胺 谷胱甘肽 胺气处理 部分 反应性(心理学) 质子化 硫醇 极性效应 半胱氨酸 药物化学 氢键 立体化学 组合化学 分子 有机化学 单体 医学 替代医学 病理 聚合物 离子
作者
Adam B. Birkholz,David J. Kopecky,Laurie P. Volak,Michael D. Bartberger,Yuping Chen,Christopher M. Tegley,Tara Arvedson,John D. McCarter,Christopher Fotsch,Victor J. Cee
出处
期刊:Journal of Medicinal Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:63 (20): 11602-11614 被引量:28
标识
DOI:10.1021/acs.jmedchem.0c00749
摘要

A comprehensive understanding of structure–reactivity relationships is critical to the design and optimization of cysteine-targeted covalent inhibitors. Herein, we report glutathione (GSH) reaction rates for N-phenyl acrylamides with varied substitutions at the α- and β-positions of the acrylamide moiety. We find that the GSH reaction rates can generally be understood in terms of the electron donating or withdrawing ability of the substituent. When installed at the β-position, aminomethyl substituents with amine pKa’s > 7 accelerate, while those with pKa’s < 7 slow the rate of GSH addition at pH 7.4, relative to a hydrogen substituent. Although a computational model was able to only approximately capture experimental reactivity trends, our calculations do not support a frequently invoked mechanism of concerted amine/thiol proton transfer and C–S bond formation and instead suggest that protonated aminomethyl functions as an electron-withdrawing group to reduce the barrier for thiolate addition to the acrylamide.
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