The dddP gene, encoding a novel enzyme that converts dimethylsulfoniopropionate into dimethyl sulfide, is widespread in ocean metagenomes and marine bacteria and also occurs in some Ascomycete fungi

二甲基磺酰丙酸盐 生物 α蛋白细菌 二甲基硫醚 基因组 基因 海洋噬菌体 大肠杆菌 细菌 微生物学 遗传学 16S核糖体RNA 生态学 浮游植物 硫黄 化学 有机化学 营养物
作者
Jonathan D. Todd,Andrew R. J. Curson,Christopher L. Dupont,P. Nicholson,Andrew Johnston
出处
期刊:Environmental Microbiology [Wiley]
卷期号:11 (6): 1376-1385 被引量:152
标识
DOI:10.1111/j.1462-2920.2009.01864.x
摘要

Summary The marine alphaproteobacterium Roseovarius nubinhibens ISM can produce the gas dimethyl sulfide (DMS) from dimethylsulfoniopropionate (DMSP), a widespread secondary metabolite that occurs in many phytoplankton. Roseovarius possesses a novel gene, termed dddP , which when cloned, confers on Escherichia coli the ability to produce DMS. The DddP polypeptide is in the large family of M24 metallopeptidases and is wholly different from two other enzymes, DddD and DddL, which were previously shown to generate DMS from dimethylsulfoniopropionate. Close homologues of DddP occur in other alphaproteobacteria and more surprisingly, in some Ascomycete fungi. These were the biotechnologically important Aspergillus oryzae and the plant pathogen, Fusarium graminearum . The dddP gene is abundant in the bacterial metagenomic sequences in the Global Ocean Sampling Expedition. Thus, dddP has several novel features and is widely dispersed, both taxonomically and geographically.

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