Comprehensive variant analysis of phospholipase A2 superfamily genes in large Chinese Parkinson’ s disease cohorts

疾病 遗传学 基因 队列 生物 帕金森病 医学 生物信息学 内科学
作者
Jiabin Liu,Yige Wang,Yuwen Zhao,Hongxu Pan,Zhenhua Liu,Qian Xu,Lu Shen,Hong Jiang,Junling Wang,Qiying Sun,Jieqiong Tan,Xinxiang Yan,Jinchen Li,Beisha Tang,Jifeng Guo
出处
期刊:Mechanisms of Ageing and Development [Elsevier BV]
卷期号:219: 111940-111940 被引量:1
标识
DOI:10.1016/j.mad.2024.111940
摘要

To clarify the genetic role of phospholipase A2 (PLA2) genes in Parkinson's disease, we performed a genetic association study in a large Chinese population cohort using next-generation sequencing. In this study, we analyzed both rare and common variants of 38 phospholipase A2 genes in two large cohorts. We detected 1558 and 1115 rare variants in the two cohort, respectively. In both cohorts, we observed suggestive associations between specific subgroups and Parkinson's disease. At the single-gene level, several genes (PLA2G2D, PLA2G12A, PLA2G12B, PLA2G4F, PNPLA1, PNPLA3, PNPLA7, PLA2G7, PLA2G15, PLAAT5, and ABHD12) showed suggestive significance in Parkinson's disease. Meanwhile, 364 and 2261 common variants were identified in two cohorts, respectively. Our study has expanded the genetic spectrum of the PLA2 family genes and suggested potential pathogenetic roles of PLA2 superfamily in Parkinson's disease.
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