Recent advances in applying omic technologies for studying acetic acid bacteria in industrial vinegar production: A comprehensive review

生物技术 背景(考古学) 生物制品 生物 鉴定(生物学) 生化工程 分离(微生物学) 有机体 醋酸菌 醋酸 工程类 生物信息学 生物化学 生态学 古生物学 生物燃料
作者
Juan J. Román‐Camacho,Juan Carlos Mauricio,Inés M. Santos‐Dueñas,Teresa García‐Martínez,Isidoro García‐García
出处
期刊:Biotechnology Journal [Wiley]
卷期号:19 (2)
标识
DOI:10.1002/biot.202300566
摘要

Abstract Vinegar and related bioproducts containing acetic acid as the main component are among the most appreciated fermented foodstuffs in numerous European and Asian countries because of their exceptional organoleptic and bio‐healthy properties. Regarding the acetification process and obtaining of final products, there is still a lack of knowledge on fundamental aspects, especially those related to the study of biodiversity and metabolism of the present microbiota. In this context, omic technologies currently allow for the massive analysis of macromolecules and metabolites for the identification and characterization of these microorganisms working in their natural media without the need for isolation. This review approaches comprehensive research on the application of omic tools for the identification of vinegar microbiota, mainly acetic acid bacteria, with subsequent emphasis on the study of the microbial diversity, behavior, and key molecular strategies used by the predominant groups throughout acetification. The current omics tools are enabling both the finding of new vinegar microbiota members and exploring underlying strategies during the elaboration process. The species Komagataeibacter europaeus may be a model organism for present and future research in this industry; moreover, the development of integrated meta‐omic analysis may facilitate the achievement of numerous of the proposed milestones. This work might provide useful guidance for the vinegar industry establishing the first steps towards the improvement of the acetification conditions and the development of new products with sensory and bio‐healthy profiles adapted to the agri‐food market.
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