[Identification of a novel variant of NHS gene underlying Nance-Horan syndrome].

先证者 遗传学 桑格测序 基因 生物 基因组DNA DNA测序 医学遗传学 基因组学 遗传连锁 突变 基因组
作者
Xiaowei Chen,Peiwen Xu,Jie Li,Yuping Niu,Ranran Kang,Yuan Gao
出处
期刊:PubMed 卷期号:38 (11): 1077-1080
标识
DOI:10.3760/cma.j.cn511374-20200817-00603
摘要

To explore the genetic basis for a pedigree affected with Nance-Horan syndrome.Clinical manifestation of the patients was analyzed. Genomic DNA was extracted from peripheral blood samples of the pedigree members and 100 unrelated healthy controls. A panel of genes for congenital cataract was subjected to next-generation sequencing (NGS), and candidate variant was verified by Sanger sequencing and bioinformatic analysis based on guidelines of American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG). mRNA expression was determined by reverse transcriptase-PCR (RT-PCR). Linkage analysis based on short tandem repeats was carried out to confirm the consanguinity.A small insertional variant c.766dupC (p.Leu256Profs*21) of the NHS gene was identified in the proband and his affected mother, but not among unaffected members and the 100 healthy controls. The variant was unreported in Human Gene Mutation Database (HGMD) and other databases. Based on the ACMG guideline, the variant is predicted to be pathogenic (PVS1+PM2+PM6+PP4).The novel variant c.766dupC of the NHS gene probably underlay the X-linked dominant Nance-Horan syndrome in this pedigree.
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