Complete Genome Sequence of Peanut stripe virus Isolated in China

生物 顺反子 基因组 打开阅读框 遗传学 全基因组测序 核酸序列 核苷酸 肽序列 序列(生物学) 系统发育树 基因 病毒学 分子生物学 大肠杆菌
作者
Manlin Xu,Fangluan Gao,Jinguang Yang,Juxiang Wu,Lianhui Xie,Yucheng Chi
出处
期刊:Journal of Phytopathology [Wiley]
卷期号:162 (11-12): 829-832 被引量:4
标识
DOI:10.1111/jph.12248
摘要

Abstract The complete genome sequence of a L aixi isolate of P eanut stripe virus ( PS t V ‐ L aixi) from C hina was determined to be 10, 056 nucleotides in length, excluding the 3′‐terminal poly (A) tail. The viral genome contains a single long open reading frame of 9669 nucleotides encoding a polyprotein of 3222 amino acids. The polyprotein was predicted to be cleaved into ten functional proteins by three viral proteases. An additional protein, termed ‘ PIPO ’, is also found in the P 3 cistron. The complete genome sequence comparison and phylogenetic analysis indicated that PS t V ‐ L aixi was most closely related to three other isolates of PS t V (two from USA and one from T aiwan). To our knowledge, this is the first report of the complete sequence of a PS t V isolate from C hina.
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