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Selection of a DNA Aptamer against Zearalenone and Docking Analysis for Highly Sensitive Rapid Visual Detection with Label-Free Aptasensor

适体 检出限 化学 指数富集配体系统进化 离解常数 组合化学 对接(动物) 胶体金 DNA 色谱法 纳米颗粒 纳米技术 材料科学 核糖核酸 生物 生物化学 受体 基因 医学 遗传学 护理部
作者
Yuanyuan Zhang,Taofeng Lu,Yue Wang,Chenxi Diao,Yan Zhou,Lili Zhao,Hongyan Chen
出处
期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:66 (45): 12102-12110 被引量:62
标识
DOI:10.1021/acs.jafc.8b03963
摘要

Contamination of feed with zearalenone (ZEN) presents a significant risk to animal health. Here, a visible, rapid, and cost-effective aptamer-based method is described for the detection of ZEN. After 8 rounds of SELEX (systematic evolution of ligands by exponential enrichment) with an affinity-based monitor and counter-screening process, the ssDNA aptamer Z100 was obtained, which had high affinity (dissociation constant = 15.2 ± 3.4 nM) and good specificity. Docking analysis of Z100 indicated that noncovalent bonds (π-π interactions, hydrogen bonds, and hydrophobic interactions) helped ZEN to anchor in the binding sites. Finally, a label-free detection method based on gold nanoparticles and Z100 at 0.25 μM was developed for ZEN determination. Excellent linearity was achieved, and the lowest detection limit was 12.5 nM. This rapid and simple method for ZEN analysis has high sensitivity and can be applied for on-site detection of ZEN in animal feeds.
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