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Complete Genomic Sequence of the Virulent Bacteriophage RAP44 of Riemerella anatipestifer

开放式参考框架 生物 长尾病毒科 基因组 噬菌体 全基因组测序 遗传学 基因 打开阅读框 肽序列 大肠杆菌
作者
Longfei Cheng,Hongmei Chen,Zheng Teng,Guanghua Fu,Shaohua Shi,Chunhe Wan,Yu Huang
出处
期刊:Avian Diseases [American Association of Avian Pathologists]
卷期号:56 (2): 321-327 被引量:10
标识
DOI:10.1637/9770-050411-reg.1
摘要

A virulent Riemerella anatipestifer bacteriophage, RAP44, belonging to the Siphoviridae family of tailed phages, was previously isolated from feces of healthy Muscovy ducks in China. A complete genomic sequence analysis indicates that the phage's genome consists of a linear, double-stranded DNA molecule of 49,329 nucleotides. Eighty open reading frames (ORF) were identified. Putative functions could be assigned to 24 of the ORFs. The location of these genes was consistent with organization of the genome in a modular format which includes modules for host cell lysis, tail morphogenesis, head morphogenesis, and DNA replication and modification modules. Until now, no R. anatipestifer phage genome sequence has been reported in the literature. Therefore, this study represents the first complete genomic and molecular description of the R. anatipestifer phage.Secuencia genómica completa del bacteriófago virulento RAP44 de Riemerella anatipestifer.Un bacteriófago virulento de Riemerella anatipestifer, RAP44, que pertenece a la familia Siphoviridae que incluye fagos con cola, fue aislado anteriormente de las heces de patos reales sanos en China. El análisis completo de la secuencia genómica indica que el genoma del fago consiste de una molécula de ADN lineal, de doble cadena de 49,329 nucleótidos. Ochenta marcos de lectura continuos (ORF) fueron identificados. Se pudieron asignar funciones supuestas a 24 de los ORFs. La ubicación de estos genes fue compatible con la organización del genoma en un formato modular que incluye módulos para la lisis de la célula huésped, para morfogénesis de la cola, y de la cabeza, y para la replicación y modificación del ADN. Hasta ahora, ninguna secuencia de un fago de R. anatipestifer se había reportado en la literatura. Por lo tanto, este estudio representa la primera descripción genómica y molecular completa de un fago de R. anatipestifer.

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