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Redondoviridae infection regulates circRNAome in periodontitis

牙周炎 生物 竞争性内源性RNA 小RNA 核糖核酸 环状RNA 基因 长非编码RNA 计算生物学 遗传学 医学 内科学
作者
Yu Zhang,Chunmei Wang,Ce Zhu,Ye Wei,Qin Gu,Chen-bin Shu,Xiping Feng,Xi Chen,Wen Zhang,Tongling Shan
出处
期刊:Journal of Medical Virology [Wiley]
卷期号:94 (6): 2537-2547 被引量:9
标识
DOI:10.1002/jmv.27624
摘要

Abstract Redondoviridae is a recently identified family of DNA viruses associated with periodontitis. Circular RNAs (circRNAs) are novel endogenous, conserved noncoding RNAs contributing to the virus‐related immune‐inflammatory response. This study aimed to analyze the expression profiles of circRNAs in the gingival tissues of periodontitis patients with and without Redondoviridae ‐infection and healthy controls using high‐throughput RNA sequencing combined with experimental validation. Out of 17 819 circRNAs, 175 were dysregulated. Functional annotation and enrichment analysis of the differential circRNA host genes demonstrated potential alterations in the molecular and cellular components and metabolism in individuals suffering from periodontitis with Redondoviridae infection. Moreover, "axon guidance," "lysine biosynthesis," and "vascular endothelial growth factor signaling pathways" were significantly enriched in Redondoviridae ‐infected gingivitis tissues. Furthermore, the key circRNAs (circCOL1A1, circAASS, circPTK2, circATP2B4, circDOCK1, circTTBK2, and circMCTP2) associated with the pathobiology of Redondoviridae ‐related periodontitis were identified by constructing circRNA–micro RNA (miRNA)–messenger RNA (mRNA) networks. Bioinformatics analyses demonstrated that abnormally expressed circRNAs might contribute to the etiopathogenesis and development of Redondoviridae ‐related periodontitis. This study's findings have enhanced the current understanding of the Redondoviridae‐related periodontitis mechanism and provide insights into further applications for diagnostic markers and therapeutic uses.
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