Pharmacokinetics Profiler (PhaKinPro): Model Development, Validation, and Implementation as a Web Tool for Triaging Compounds with Undesired Pharmacokinetics Profiles

药物数据库 药代动力学 数量结构-活动关系 药物发现 计算机科学 药物开发 数据库 药品 数据挖掘 化学 机器学习 药理学 医学 生物化学
作者
Marielle Rath,James Wellnitz,Holli-Joi Martin,Cleber C. Melo-Filho,Joshua Hochuli,Guilherme Martins Silva,Jon-Michael Beasley,Mark D. Travis,Zoe Sessions,Konstantin Popov,Alexey Zakharov,Artem Cherkasov,Vinícius M. Alves,Eugene Muratov,Alexander Tropsha
出处
期刊:Journal of Medicinal Chemistry [American Chemical Society]
标识
DOI:10.1021/acs.jmedchem.3c02446
摘要

Computational models that predict pharmacokinetic properties are critical to deprioritize drug candidates that emerge as hits in high-throughput screening campaigns. We collected, curated, and integrated a database of compounds tested in 12 major end points comprising over 10,000 unique molecules. We then employed these data to build and validate binary quantitative structure-activity relationship (QSAR) models. All trained models achieved a correct classification rate above 0.60 and a positive predictive value above 0.50. To illustrate their utility in drug discovery, we used these models to predict the pharmacokinetic properties for drugs in the NCATS Inxight Drugs database. In addition, we employed the developed models to predict the pharmacokinetic properties of all compounds in the DrugBank. All models described in this paper have been integrated and made publicly available via the PhaKinPro Web-portal that can be accessed at https://phakinpro.mml.unc.edu/.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
刚刚
刚刚
小点点完成签到,获得积分10
3秒前
maomao发布了新的文献求助10
4秒前
dddd17关注了科研通微信公众号
5秒前
sophyia完成签到,获得积分20
6秒前
汉堡包应助科研通管家采纳,获得10
6秒前
田様应助科研通管家采纳,获得10
6秒前
6秒前
xs完成签到,获得积分10
6秒前
小点点发布了新的文献求助10
7秒前
zz完成签到,获得积分10
7秒前
yps发布了新的文献求助100
7秒前
hxm完成签到,获得积分10
7秒前
李健应助fantexi113采纳,获得10
9秒前
9秒前
集力申完成签到,获得积分10
10秒前
12秒前
13秒前
愉快凝梦完成签到 ,获得积分10
13秒前
lfl发布了新的文献求助10
17秒前
18秒前
细腻的怀蕊完成签到 ,获得积分10
19秒前
ooseabiscuit完成签到,获得积分10
19秒前
21秒前
acd发布了新的文献求助10
23秒前
研友_850EYZ完成签到,获得积分10
26秒前
26秒前
27秒前
28秒前
30秒前
Wxxxxx发布了新的文献求助10
31秒前
哭泣科研民工完成签到,获得积分10
32秒前
ccalvintan发布了新的文献求助10
32秒前
37秒前
40秒前
Chanyl完成签到,获得积分20
40秒前
41秒前
大壮_0808完成签到,获得积分10
42秒前
48秒前
高分求助中
Teaching Social and Emotional Learning in Physical Education 900
Recherches Ethnographiques sue les Yao dans la Chine du Sud 500
Plesiosaur extinction cycles; events that mark the beginning, middle and end of the Cretaceous 500
Two-sample Mendelian randomization analysis reveals causal relationships between blood lipids and venous thromboembolism 500
Chinese-English Translation Lexicon Version 3.0 500
[Lambert-Eaton syndrome without calcium channel autoantibodies] 440
薩提亞模式團體方案對青年情侶輔導效果之研究 400
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 有机化学 工程类 生物化学 纳米技术 物理 内科学 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 电极 光电子学 量子力学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 2388639
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2094819
关于积分的说明 5274498
捐赠科研通 1821785
什么是DOI,文献DOI怎么找? 908696
版权声明 559437
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 485524