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Integrative analysis of lysine acetylation-related genes and identification of a novel prognostic model for oral squamous cell carcinoma

乙酰化 癌症 癌症研究 基底细胞 肿瘤科 赖氨酸 医学 基因 内科学 生物 氨基酸 遗传学
作者
Shi‐Zhou Deng,Xuechen Wu,Jiezhang Tang,Lin Dai,Bo Cheng
出处
期刊:Frontiers in Molecular Biosciences [Frontiers Media]
卷期号:10 被引量:5
标识
DOI:10.3389/fmolb.2023.1185832
摘要

Introduction: Oral squamous cell carcinoma (OSCC), which accounts for a high proportion of oral cancers, is characterized by high aggressiveness and rising incidence. Lysine acetylation is associated with cancer pathogenesis. Lysine acetylation-related genes (LARGs) are therapeutic targets and potential prognostic indicators in various tumors, including oral squamous cell carcinoma. However, systematic bioinformatics analysis of the Lysine acetylation-related genes in Oral squamous cell carcinoma is still unexplored. Methods: We analyzed the expression of 33 Lysine acetylation-related genes in oral squamous cell carcinoma and the effects of their somatic mutations on oral squamous cell carcinoma prognosis. Consistent clustering analysis identified two lysine acetylation patterns and the differences between the two patterns were further evaluated. Least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) regression analysis was used to develop a lysine acetylation-related prognostic model using TCGA oral squamous cell carcinoma datasets, which was then validated using gene expression omnibus (GEO) dataset GSE41613. Results: Patients with lower risk scores had better prognoses, in both the overall cohort and within the subgroups These patients also had "hot" immune microenvironments and were more sensitive to immunotherapy. Disscussion: Our findings offer a new model for classifying oral squamous cell carcinoma and determining its prognosis and offer novel insights into oral squamous cell carcinoma diagnosis and treatment.

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