Optogenetic Modulation of a Catalytic Biofilm for the Biotransformation of Indole into Tryptophan

生物膜 光遗传学 生物转化 化学 吲哚试验 生物催化 色氨酸 合成生物学 生物物理学 催化作用 组合化学 纳米技术 生物化学 细菌 生物 材料科学 反应机理 计算生物学 遗传学 氨基酸 神经科学
作者
Yidan Hu,Xiaobo Liu,Aloysius Teng Min Ren,Ji‐Dong Gu,Bin Cao
出处
期刊:Chemsuschem [Wiley]
卷期号:12 (23): 5142-5148 被引量:22
标识
DOI:10.1002/cssc.201902413
摘要

Abstract In green chemical synthesis, biofilms as biocatalysts have shown great promise. Efficient biofilm‐mediated biocatalysis requires the modulation of biofilm formation. Optogenetic tools are ideal to control biofilms because light is noninvasive, easily controllable, and cost‐efficient. In this study, a gene circuit responsive to near‐infrared (NIR) light was used to modulate the cellular level of bis‐(3′‐5′) cyclic dimeric guanosine monophosphate (c‐di‐GMP), a central regulator of the prokaryote biofilm lifestyle, which allowed the regulation of biofilm formation by using NIR light. The engineered biofilm was applied to catalyze the biotransformation of indole into tryptophan in submerged biofilm reactors and NIR‐light‐enhanced biofilm formation resulted in an approximately 30 % increase in tryptophan yield, which demonstrates the feasibility of the application of light to modulate the formation and performance of catalytic biofilms for chemical production. The c‐di‐GMP‐targeted optogenetic approach to modulate catalytic biofilms showcases applications for biofilm‐mediated biocatalysis.
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