Drug Target Interplay: A Network-based Analysis of Human Diseases and the Drug Targets

相互作用体 计算生物学 交互网络 药品 药物发现 药物靶点 药物重新定位 疾病 基因 计算机科学 基因调控网络 生物 生物信息学 遗传学 医学 药理学 基因表达 病理
作者
Bhushan Jain,Utkarsh Raj,Pritish Kumar Varadwaj
出处
期刊:Current Topics in Medicinal Chemistry [Bentham Science Publishers]
卷期号:18 (13): 1053-1061 被引量:20
标识
DOI:10.2174/1568026618666180719160922
摘要

Screening and identifying a disease-specific novel drug target is the first step towards a rational drug designing approach. Due to the advent of high throughput data generation techniques, the protein search space has now exceeded 24,500 human protein coding genes, which encodes approximately 1804proteins. This work aims at mining out the relationship between target proteins, drugs, and diseases genes through a network-based systems biology approach. A network of all FDA approved drugs, along with their targets were utilized to construct the proposed Drug Target (DT) network. Further, the experimental drugs were mapped into the DT network to infer the functional relationship by utilizing the respective network attributes. Similar to the DT network, a network of disease genes was created through OMIM Gene Map and Morbid Map, to link the binary associations of disorder-disease genes. In the proposed model of Human Interactome Network, shortest path length between the target protein and disease gene was used to infer the correlation between 'Drug Targets' and 'Disease-Gene'. This network-based study will help researchers to analyze, infer and identify disease-specific novel drug targets through harnessing the graph theory based network attributes.
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