The Genotype-Tissue Expression (GTEx) pilot analysis: Multitissue gene regulation in humans

表达数量性状基因座 生物 基因 基因表达 遗传变异 遗传学 基因表达调控 基因型 单核苷酸多态性
作者
Kristin G. Ardlie,David S. DeLuca,Ayellet V. Segrè,Timothy J. Sullivan,Taylor Young,Ellen Gelfand,Casandra A. Trowbridge,Julian Maller,Taru Tukiainen,Monkol Lek,Lucas D. Ward,Pouya Kheradpour,Benjamin Iriarte,Yan Meng,Cameron D. Palmer,Tõnu Esko,Wendy Winckler,Joel N. Hirschhorn,Manolis Kellis,Daniel G. MacArthur
出处
期刊:Science [American Association for the Advancement of Science]
卷期号:348 (6235): 648-660 被引量:5018
标识
DOI:10.1126/science.1262110
摘要

Expression, genetic variation, and tissues Human genomes show extensive genetic variation across individuals, but we have only just started documenting the effects of this variation on the regulation of gene expression. Furthermore, only a few tissues have been examined per genetic variant. In order to examine how genetic expression varies among tissues within individuals, the Genotype-Tissue Expression (GTEx) Consortium collected 1641 postmortem samples covering 54 body sites from 175 individuals. They identified quantitative genetic traits that affect gene expression and determined which of these exhibit tissue-specific expression patterns. Melé et al. measured how transcription varies among tissues, and Rivas et al. looked at how truncated protein variants affect expression across tissues. Science , this issue p. 648 , p. 660 , p. 666 ; see also p. 640
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