Glutamate racemase as a target for drug discovery

药物发现 肽聚糖 五肽重复序列 生物化学 生物 计算生物学 保守序列 谷氨酸受体 活动站点 氨基酸 基因 肽序列 受体
作者
Stewart L. Fisher
出处
期刊:Microbial biotechnology [Wiley]
卷期号:1 (5): 345-360 被引量:78
标识
DOI:10.1111/j.1751-7915.2008.00031.x
摘要

Summary The bacterial cell wall is a highly cross‐linked polymeric structure consisting of repeating peptidoglycan units, each of which contains a novel pentapeptide substitution which is cross‐linked through transpeptidation. The incorporation of d ‐glutamate as the second residue is strictly conserved across the bacterial kingdom. Glutamate racemase, a member of the cofactor‐independent, two‐thiol‐based family of amino acid racemases, has been implicated in the production and maintenance of sufficient d ‐glutamate pool levels required for growth. The subject of over four decades of research, it is now evident that the enzyme is conserved and essential for growth across the bacterial kingdom and has a conserved overall topology and active site architecture; however, several different mechanisms of regulation have been observed. These traits have recently been targeted in the discovery of both narrow and broad spectrum inhibitors. This review outlines the biological history of this enzyme, the recent biochemical and structural characterization of isozymes from a wide range of species and developments in the identification of inhibitors that target the enzyme as possible therapeutic agents.
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