A Novel Linear Machine Learning Method Based on DNA Hybridization Reaction Circuit

计算机科学 分子生物物理学 DNA 人工智能 生物系统 计算生物学 纳米技术 物理 材料科学 生物 遗传学 核磁共振
作者
Changhong Zou,Qiang Zhang,Bin Wang,Changjun Zhou,Yong Yang,Xuncai Zhang
出处
期刊:IEEE Transactions on Nanobioscience [Institute of Electrical and Electronics Engineers]
卷期号:24 (3): 374-385
标识
DOI:10.1109/tnb.2025.3559480
摘要

DNA hybridization reaction is a significant technology in the field of semi-synthetic biology and holds great potential for use in biological computation. In this study, we propose a novel machine learning model based on a DNA hybridization reaction circuit. This circuit comprises a computation training component, a test component, and a learning algorithm. Compared to conventional machine learning models based on semiconductors, the proposed machine learning model harnesses the power of DNA hybridization reaction, with the learning algorithm implemented based on the unique properties of DNA computation, enabling parallel computation for the acquisition of learning results. In contrast to existing machine learning models based on DNA circuits, our proposed model constitutes a complete synthetic biology computation system, and utilizes the "dual-rail" mechanism to achieve the DNA compilation of the learning algorithm, which allows the weights to be updated to negative values. The proposed machine learning model based on DNA hybridization reaction demonstrates the ability to predict and fit linear functions. As such, this study is expected to make significant contributions to the development of machine learning through DNA hybridization reaction circuits.
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