Quantitative real time PCR for the measurement of white spot syndrome virus in shrimp

白斑综合征 小虾 生物 肝胰腺 斑节对虾 病毒 病毒学 血淋巴 聚合酶链反应 实时聚合酶链反应 对虾 基因 渔业 遗传学 生态学
作者
Stéphanie Durand,Donald V. Lightner
出处
期刊:Journal of Fish Diseases [Wiley]
卷期号:25 (7): 381-389 被引量:210
标识
DOI:10.1046/j.1365-2761.2002.00367.x
摘要

Quantitative real time PCR, recently developed in molecular biology, is applied in this paper to quantify the white spot syndrome virus (WSSV) in infected shrimp tissue. The WSSV content in moribund shrimp of all species tested ( Penaeus stylirostris, P. monodon, P. vannamei ) ranged from 2.0 × 10 4 to 9.0 × 10 10 WSSV copies μg –1 of total DNA ( n =26). In whole moribund post‐larvae, 4.3 × 10 9 WSSV copies μg –1 of DNA were detected which is equivalent to 5.7 × 10 10 WSSV copies g –1 of post‐larvae. The comparison of WSSV content between different tissues showed that muscle and hepatopancreas tissues contained 10 times less virus than gills, pleopods and haemolymph. With inocula of known virus content, bioassays by immersion challenge showed that a minimum of five logs of WSSV copies was necessary to establish disease in the challenged shrimp. In contrast, five logs of WSSV copies injected into shrimp muscle produced a LT‐50 of 52 h. This real time polymerase chain reaction (PCR) technique is sensitive (four copies), specific (negative with DNA from shrimp baculoviruses and parvoviruses), dynamic (seven logs) and easy to perform (96 tests in <4 h).

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