亲爱的研友该休息了!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整地填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您度过漫漫科研夜!身体可是革命的本钱,早点休息,好梦!

[Detection of Exosomal PML-RARA Fusion Gene Expression Level by Droplet Digital PCR].

融合基因 分子生物学 数字聚合酶链反应 急性早幼粒细胞白血病 生物 塔克曼 基因 基因表达 实时聚合酶链反应 病毒学 聚合酶链反应 遗传学 维甲酸
作者
Hui Zhu,Zhe-Ying Wang,Xueqin Ding,Ruixian Wang,Xiaorong Pan,Jianhua Tong
出处
期刊:PubMed [National Institutes of Health]
卷期号:27 (3): 747-752 被引量:1
标识
DOI:10.19746/j.cnki.issn.1009-2137.2019.03.017
摘要

To establish a method for detecting the exosomal PML-RARA fusion gene expression by droplet digital PCR (ddPCR).By using Taqman probe-based ddPCR technique, the method that able to detect both long and short isoforms of PML-RARA fusion gene transcripts was established. RNA from PML-RARA negative cell line HL-60 as negative control was used to set the limit of blank (LOB), while the RNA from PML-RARA positive cell line NB4 and the recombinant plasmid pSG5-PML-RARA(S) were used to set the limit of detection (LOD) for long and short PML-RARA transcripts, respectively. Furtherly, the expression of exosomal PML-RARA fusion gene in NB4 cell culture supernatant and serum of patients with acute promyelocytic leukemia (APL) was analyzed by ddPCR technique.The LOB of ddPCR assay for long and short PML-RARA transcripts were 0.0725 and 0.083 copies per microliter of PCR reaction system, respectively, while the LOD of long and short PML-RARA transcripts were 0.19 and 0.21 copies per microliter of PCR reaction system, respectively. In addition, the expression of exosomal PML-RARA fusion gene derived from both NB4 cell culture supernatant and serum of APL patients was successfully detected.A ddPCR-based technique for detecting fusion gene transcripts has been established, which can be used to analyze absolute quantification in the minimal quantity of PML-RARA transcripts derived from exosomes. It suggests the possibility of this technique to non-invasively and dynamicly monitore the exosomal PML-RARA transcripts from APL patients' serum.微滴式数字PCR技术检测外泌体PML-RARA融合基因的表达.利用微滴式数字PCR技术检测外泌体中PML-RARA融合基因表达水平.使用基于Taqman探针法的ddPCR技术,建立可检测长型和短型PML-RARA融合基因转录本的方法。以PML-RARA阴性细胞株HL-60细胞的RNA逆转录合成的cDNA为阴性对照建立空白检测限(LOB);以表达长型PML-RARA融合基因的NB4细胞RNA逆转录合成的cDNA和含短型PML-RARA cDNA的重组质粒为模板分别确定两者的最低检测限(LOD);并检测NB4细胞培养上清来源的外泌体和急性早幼粒白血病患者血清来源的外泌体中PML-RARA融合基因的表达情况.采用ddPCR技术针对长型和短型PML-RARA转录本测得的LOB分别为每微升PCR反应体系中含0.0725拷贝和0.083拷贝;测得的LOD分别为每微升PCR反应体系中含0.19拷贝和0.21拷贝;使用该检测方法,在NB4细胞培养上清来源的外泌体和急性早幼粒细胞白血病患者血清来源的外泌体中均可检测到PML-RARA 融合基因的表达.建立了一种基于ddPCR技术检测融合基因转录本的方法,可对外泌体中的微量PML-RARA转录本进行绝对定量,为无创动态监测急性早幼粒细胞白血病患者血清外泌体中PML-RARA融合基因的表达水平提供了可能.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
刚刚
轩xxx发布了新的文献求助10
6秒前
10秒前
魔幻的访云完成签到 ,获得积分10
14秒前
YuJiao发布了新的文献求助10
15秒前
共享精神应助小乔采纳,获得10
15秒前
17秒前
22秒前
Criminology34应助科研通管家采纳,获得10
23秒前
23秒前
Criminology34应助科研通管家采纳,获得10
23秒前
时不我待C发布了新的文献求助10
26秒前
mmyhn发布了新的文献求助10
28秒前
30秒前
32秒前
33秒前
充电宝应助mmyhn采纳,获得10
34秒前
Jason发布了新的文献求助10
35秒前
36秒前
追寻电脑发布了新的文献求助10
37秒前
HH发布了新的文献求助30
37秒前
ZikiGao关注了科研通微信公众号
37秒前
小二郎应助Baibai采纳,获得10
38秒前
38秒前
lcw发布了新的文献求助10
39秒前
41秒前
冷静发布了新的文献求助10
41秒前
Lucas应助Jason采纳,获得10
44秒前
KDC发布了新的文献求助10
45秒前
宛在水中央完成签到 ,获得积分10
46秒前
49秒前
51秒前
Baibai发布了新的文献求助10
52秒前
无限的白羊完成签到 ,获得积分10
54秒前
KDC发布了新的文献求助10
57秒前
Neil完成签到,获得积分10
58秒前
59秒前
1分钟前
KDC完成签到,获得积分10
1分钟前
HH发布了新的文献求助10
1分钟前
高分求助中
Principles of Economics, 11th Edition 10000
University Physics with Modern Physics, 16th edition 10000
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
48V Low-voltage Power Distribution Network (PDN) Architecture Industry Report, 2024 800
ズームレンズの光学設計に関する研究 800
Fundamentals of Pharmaceutical and Biologics Regulations: A Global Perspective, Second Edition 700
Matrix Methods in Data Mining and Pattern Recognition Second Edition 610
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 内科学 物理 复合材料 催化作用 细胞生物学 无机化学 光电子学 物理化学 电极 基因
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 7297348
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 8915843
关于积分的说明 18878861
捐赠科研通 6963012
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3210524
关于科研通互助平台的介绍 2379855
邀请新用户注册赠送积分活动 2187016