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Crystal structure of native α-L-rhamnosidase from Aspergillus terreus

土曲霉 化学 劈开 立体化学 催化作用 基质(水族馆) 生物化学 生物 生态学
作者
Petr Pachl,Jana Škerlová,Daniela Šimčíková,Michael Kotik,Alena Křenková,P. Mäder,J. Brynda,Jana Kapešová,Vladimı́r Křen,Zbyszek Otwinowski,Pavlína Řezáčová
标识
DOI:10.1107/s2059798318013049
摘要

α-L-Rhamnosidases cleave terminal nonreducing α-L-rhamnosyl residues from many natural rhamnoglycosides. This makes them catalysts of interest for various biotechnological applications. The X-ray structure of the GH78 family α-L-rhamnosidase from Aspergillus terreus has been determined at 1.38 Å resolution using the sulfur single-wavelength anomalous dispersion phasing method. The protein was isolated from its natural source in the native glycosylated form, and the active site contained a glucose molecule, probably from the growth medium. In addition to its catalytic domain, the α-L-rhamnosidase from A. terreus contains four accessory domains of unknown function. The structural data suggest that two of these accessory domains, E and F, might play a role in stabilizing the aglycon portion of the bound substrate.

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