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Genome‐wide association studies: utility and limitations for research in physiology

全基因组关联研究 多效性 生物 遗传关联 计算生物学 基因组学 孟德尔随机化 基因分型 表型 遗传学 特质 进化生物学 基因组 单核苷酸多态性 基因 遗传变异 基因型 计算机科学 程序设计语言
作者
Nicolas Pereira Ciochetti,Beatriz Lugli‐Moraes,Bruna Santos da Silva,Diego Luiz Rovaris
出处
期刊:The Journal of Physiology [Wiley]
卷期号:601 (14): 2771-2799
标识
DOI:10.1113/jp284241
摘要

Physiological systems are subject to interindividual variation encoded by genetics. Genome-wide association studies (GWAS) operate by surveying thousands of genetic variants from a substantial number of individuals and assessing their association to a trait of interest, be it a physiological variable, a molecular phenotype (e.g. gene expression), or even a disease or condition. Through a myriad of methods, GWAS downstream analyses then explore the functional consequences of each variant and attempt to ascertain a causal relationship to the phenotype of interest, as well as to delve into its links to other traits. This type of investigation allows mechanistic insights into physiological functions, pathological disturbances and shared biological processes between traits (i.e. pleiotropy). An exciting example is the discovery of a new thyroid hormone transporter (SLC17A4) and hormone metabolising enzyme (AADAT) from a GWAS on free thyroxine levels. Therefore, GWAS have substantially contributed with insights into physiology and have been shown to be useful in unveiling the genetic control underlying complex traits and pathological conditions; they will continue to do so with global collaborations and advances in genotyping technology. Finally, the increasing number of trans-ancestry GWAS and initiatives to include ancestry diversity in genomics will boost the power for discoveries, making them also applicable to non-European populations.

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