The identification of metabolites from gut microbiota in coronary heart disease via network pharmacology

肠道菌群 生物 毛螺菌科 对接(动物) 信号转导 受体 药理学 计算生物学 生物化学 医学 护理部 16S核糖体RNA 基因 厚壁菌
作者
Hao-Ming Zhou,Xinyu Yang,Shi‐Jun Yue,Wenxiao Wang,Qiao Zhang,Ding‐Qiao Xu,Jiajia Li,Yuping Tang
出处
期刊:Artificial Cells Nanomedicine and Biotechnology [Informa]
卷期号:52 (1): 145-155
标识
DOI:10.1080/21691401.2024.2319827
摘要

Although the gut microbial metabolites exhibit potential effects on coronary heart disease (CHD), the underlying mechanism remains unclear. In this study, the active gut microbial metabolites acting on CHD and their potential mechanisms of action were explored through a network pharmacological approach. We collected a total of 208 metabolites from the gutMgene database and 726 overlapping targets from the similarity ensemble approach (SEA) and SwissTargetPrediction (STP) database, and ultimately identified 610 targets relevant to CHD. In conjunction with the gutMGene database, we identified 12 key targets. The targets of exogenous substances were removed, and 10 core targets involved in CHD were eventually retained. The microbiota–metabolites–targets–signalling pathways network analysis revealed that C-type lectin receptor signalling pathway, Lachnospiraceae, Escherichia, mitogen-activated protein kinase 1, prostaglandin-endoperoxidase synthase 2, phenylacetylglutamine and alcoholic acid are notable components of CHD and play important roles in the development of CHD. The results of molecular docking experiments demonstrated that AKT1-glycocholic acid and PTGS2-phenylacetylglutamine complexes may act on C-type lectin receptor signalling pathways. In this study, the key substances and potential mechanisms of gut microbial metabolites were analysed via network pharmacological methods, and a scientific basis and comprehensive idea were provided for the effects of gut microbial metabolites on CHD.
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