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Development and application of a droplet digital polymerase chain reaction (ddPCR) for detection and investigation of African swine fever virus.

数字聚合酶链反应 聚合酶链反应 检出限 分子生物学 实时聚合酶链反应 病毒学 化学 生物 色谱法 基因 遗传学
作者
Xulong Wu,Xiao Lu,Hua Lin,Shijie Chen,Miao Yang,Wei An,Yin Wang,Zexiao Yang,Xueping Yao,Zizhong Tang
出处
期刊:PubMed 卷期号:82 (1): 70-74 被引量:8
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摘要

The aim of this study was to develop a droplet digital polymerase chain reaction (ddPCR) method to detect African swine fever virus (ASFV). The methods of ASFV real-time PCR and ddPCR were established and optimal reaction conditions were confirmed. Each method was evaluated for linearity, limit of detection, and specificity. The results indicated that ASFV ddPCR had a high degree of linearity (R2 ≥ 0.998) and specificity. The detection limit was 10 copies/reaction, which was approximately a 10-fold greater sensitivity than real-time PCR. This sensitive method could be used as an efficient molecular biology tool to diagnose ASFV, which is very important for preventing the spread of diseases across borders.L’objectif de la présente étude était de développer une méthode d’amplification en chaîne par la polymérase sur gouttelettes digitales (ACPgd) afin de détecter le virus de la peste porcine Africaine (VPPA). Les méthodes d’ACP en temps réel et de d’ACPgd pour le VPPA furent établies et les conditions optimales de réaction ont été confirmées. Chaque méthode fut évaluée pour sa linéarité, la limite de détection, et la spécificité. Les résultats indiquèrent que la méthode ACPgd avait un plus haut degré de linéarité (R2 ≥ 0,998) et de spécificité. La limite de détection était de 10 copies/réaction, ce qui était approximativement un degré de sensibilité 10 fois plus grand que l’ACP en temps réel. Cette méthode sensible pourrait être utilisée comme un outil de biologie moléculaire efficace afin de diagnostiquer l’infection par le VVPA, ce qui est très important pour prévenir la dissémination de maladies outre frontières.(Traduit par Docteur Serge Messier).

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