The WRKY Gene Family in Rice （Oryza sativa）

WRKY 基因编码涉及各种各样的生物学过程的规定的抄写因素。这些锌手指蛋白质，特别调停的那些成员强调回答，特别地在植物被扩展。便于进化历史的学习和这个超级基因家庭的功能，我们用 HMMER 和明确地为米饭被训练的一个隐藏的 Markov 模型为 WRKY 基因执行了彻底的搜索。这个工作在 Oryza sativa L 导致了 WRKY 基因模型的一张全面的表。ssp。indica 和 L。ssp。装饰用的梨树。这些基因印射，导致 98 的鉴定单个染色体便于消除在装饰用的梨树的冗余的 WRKY 基因并且 102 在 indica 米饭。这些基因进一步根据他们的锌手指领域的数字和结构被分类。在相应 indica 和装饰用的梨树染色体上基于保存 WRKY 领域的一棵系统树和 WRKY loci 的图形的显示，我们识别了可能的 WRKY 在内的基因复制，和在二密切相关的米饭亚种之间的损失。另外考察了在到水杨酸和 jasmonic 酸，种子发展和萌芽的抗病性和回答的 WRKYgenes 的角色被赤霉素，包括老朽的另外的发展过程，和对不能生活的压力和 abscisic 酸的回答在大米和另外的工厂调停。发信号小径调停 WRKY 基因表示也被讨论……