Human enteric Caliciviridae: a new prevalent small round-structured virus group defined by RNA-dependent RNA polymerase and capsid diversity

生物 衣壳 诺沃克病毒 病毒学 核糖核酸 杯状病毒科 RNA聚合酶 病毒 肽序列 遗传学 基因 诺如病毒
作者
S. M. Green,Kate E. Dingle,Paul R. Lambden,E O Caul,Charles R. Ashley,Ian N. Clarke
出处
期刊:Journal of General Virology [Microbiology Society]
卷期号:75 (8): 1883-1888 被引量:110
标识
DOI:10.1099/0022-1317-75-8-1883
摘要

Sequence comparison of the RNA-dependent RNA polymerases of small round-structured viruses (SRSVs) from 10 recent U.K, outbreaks of gastroenteritis revealed significant genetic variation. Computer analyses indicated that these viruses can be divided into two discrete groups. SRSV group I contains the previously characterized antigenic type 1 Norwalk and type 3 Southampton viruses. The amino acid sequences of the RNA polymerase, capsid and ORF3 of these two viruses are relatively similar (about 92%, 69% and 72% amino acid identity, respectively). A representative member of group II SRSVs, Bristol virus, was subjected to a detailed genetic analysis. Bristol virus is a recent antigenic type 2 isolate from a U.K. hospital outbreak of gastroenteritis. Using a single clinical sample the 3′-terminal 3881 nucleotide cDNA sequence [excluding the poly(A) tail] of this virus was determined. Analysis of the sequence revealed significant differences from those of group I viruses with the RNA polymerase region, capsid and ORF3 showing only about 62%, 43% and 30% amino acid identity respectively with the equivalent proteins of the Norwalk and Southampton viruses. These data suggest that the morphologically identical SRSVs belong to at least two genetically distinct groups.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
刚刚
自由依白发布了新的文献求助10
1秒前
1秒前
去阿中午发布了新的文献求助10
2秒前
wang完成签到,获得积分10
2秒前
珺晔发布了新的文献求助10
2秒前
3秒前
深情雪珊完成签到,获得积分10
4秒前
月下独酌完成签到,获得积分10
4秒前
英俊的铭应助fang20130608采纳,获得10
4秒前
4秒前
lx完成签到,获得积分10
4秒前
77222完成签到,获得积分20
4秒前
zyang完成签到,获得积分10
4秒前
思源应助复杂的熊猫采纳,获得10
5秒前
天天快乐应助childe采纳,获得10
5秒前
5秒前
5秒前
5秒前
天天快乐应助滴滴答答采纳,获得10
5秒前
迷人听蓉完成签到,获得积分10
6秒前
123应助喜悦的斓采纳,获得20
6秒前
万能图书馆应助许峰采纳,获得20
6秒前
悲凉的冰香完成签到,获得积分10
6秒前
anny2022完成签到,获得积分10
6秒前
7秒前
小二郎应助球球采纳,获得10
7秒前
神勇幻枫发布了新的文献求助10
7秒前
彭于晏应助yyuu采纳,获得10
7秒前
fighter完成签到,获得积分10
7秒前
沏碗麻花完成签到,获得积分10
8秒前
zxzb发布了新的文献求助10
8秒前
飘逸手链发布了新的文献求助10
8秒前
赘婿应助逐风的牧师采纳,获得30
8秒前
革微桂完成签到 ,获得积分10
8秒前
来吃点烧鸡完成签到,获得积分10
8秒前
家旺完成签到,获得积分10
9秒前
9秒前
Hincai完成签到 ,获得积分10
9秒前
华仔应助大麦迪采纳,获得10
9秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
The anomeric effect 1000
Principles of town planning: translating concepts to applications 1000
1 Peter and Christ's Descent to the Dead in Its Early Christian Reception 700
Nature-Inspired Computing: Concepts, Methodologies, Tools, and Applications 600
Perfectionism in School 600
Organizational Behavior 510
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 内科学 物理 复合材料 催化作用 细胞生物学 无机化学 光电子学 物理化学 电极 基因
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 7729943
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 9281896
关于积分的说明 20145945
捐赠科研通 7307358
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3303343
关于科研通互助平台的介绍 2456188
邀请新用户注册赠送积分活动 2311754