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Structure of a ribonucleotide reductase R2 protein radical

核苷酸还原酶 蛋白质亚单位 化学 电子转移 电子传输链 飞秒 激进的 核苷酸 结晶学 蛋白质结构 质子耦合电子转移 生物物理学 立体化学 光化学 激光器 生物化学 生物 核苷酸 物理 光学 基因
作者
Hugo Lebrette,Vivek Srinivas,Juliane John,Oskar Aurelius,Rohit Kumar,Daniel Lundin,Aaron S. Brewster,Asmit Bhowmick,Abhishek Sirohiwal,In-Sik Kim,Sheraz Gul,Cindy C. Pham,Kyle D. Sutherlin,Philipp S. Simon,A. Butryn,Pierre Aller,Allen M. Orville,Franklin D. Fuller,Roberto Alonso-Mori,A. Batyuk,Nicholas K. Sauter,Vittal K. Yachandra,Junko Yano,Ville R. I. Kaila,Britt‐Marie Sjöberg,Jan Kern,Katarina Roos,Martin Högbom
出处
期刊:Science [American Association for the Advancement of Science (AAAS)]
卷期号:382 (6666): 109-113
标识
DOI:10.1126/science.adh8160
摘要

Aerobic ribonucleotide reductases (RNRs) initiate synthesis of DNA building blocks by generating a free radical within the R2 subunit; the radical is subsequently shuttled to the catalytic R1 subunit through proton-coupled electron transfer (PCET). We present a high-resolution room temperature structure of the class Ie R2 protein radical captured by x-ray free electron laser serial femtosecond crystallography. The structure reveals conformational reorganization to shield the radical and connect it to the translocation path, with structural changes propagating to the surface where the protein interacts with the catalytic R1 subunit. Restructuring of the hydrogen bond network, including a notably short O–O interaction of 2.41 angstroms, likely tunes and gates the radical during PCET. These structural results help explain radical handling and mobilization in RNR and have general implications for radical transfer in proteins.
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