Establishment of RPA-Cas12a-Based Fluorescence Assay for Rapid Detection of Feline Parvovirus

重组酶聚合酶扩增 病毒学 检出限 分子生物学 细小病毒 实时聚合酶链反应 生物 聚合酶链反应 荧光 化学 基因 色谱法 遗传学 病毒 物理 量子力学
作者
Ting Wang,Hao Zeng,Qiming Liu,Weidong Qian,Yongdong Li,Jian Liu,Rong Xu
出处
期刊:Polish Journal of Microbiology [Exeley Inc]
卷期号:73 (1): 39-48 被引量:2
标识
DOI:10.33073/pjm-2024-005
摘要

Abstract Feline parvovirus (FPV) is highly infectious for cats and other Felidae and often causes severe damage to young kittens. In this study, we incorporated recombinase polymerase amplification (RPA) and Cas12a-mediated detection and developed an RPA-Cas12a-based real-time or end-point fluorescence detection method to identify the NS1 gene of FPV. The total time of RPA-Cas12a-based fluorescence assay is approximately 25 min. The assay presented a limit of detection (LOD) of 1 copies/μl (25 copies/per reaction), with no cross-reactivity with several feline pathogens. The clinical performance of the assay was examined using total genomic DNA purified from 60 clinical specimens and then compared to results obtained with qPCR detection of FPV with 93.3% positive predictive agreement and 100% negative predictive agreement. Together, the rapid reaction, cost-effectiveness, and high sensitivity make the RPA-Cas12a-based fluorescence assay a fascinating diagnostic tool that will help minimize infection spread through instant detection of FPV.

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