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The proteome of Hypobaric Induced Hypoxic Lung: Insights from Temporal Proteomic Profiling for Biomarker Discovery

生物标志物发现 蛋白质组 蛋白质组学 生物标志物 计算生物学 仿形(计算机编程) 生物信息学 医学 生物 病理 计算机科学 遗传学 基因 操作系统
作者
Yasmin Ahmad,Narendra Kumar Sharma,Mohammad Faiz Ahmad,Manish Sharma,Iti Garg,Mousami Srivastava,Kalpana Bhargava
出处
期刊:Scientific Reports [Springer Nature]
卷期号:5 (1) 被引量:33
标识
DOI:10.1038/srep10681
摘要

Abstract Exposure to high altitude induces physiological responses due to hypoxia. Lungs being at the first level to face the alterations in oxygen levels are critical to counter and balance these changes. Studies have been done analysing pulmonary proteome alterations in response to exposure to hypobaric hypoxia. However, such studies have reported the alterations at specific time points and do not reflect the gradual proteomic changes. These studies also identify the various biochemical pathways and responses induced after immediate exposure and the resolution of these effects in challenge to hypobaric hypoxia. In the present study, using 2-DE/MS approach, we attempt to resolve these shortcomings by analysing the proteome alterations in lungs in response to different durations of exposure to hypobaric hypoxia. Our study thus highlights the gradual and dynamic changes in pulmonary proteome following hypobaric hypoxia. For the first time, we also report the possible consideration of SULT1A1, as a biomarker for the diagnosis of high altitude pulmonary edema (HAPE). Higher SULT1A1 levels were observed in rats as well as in humans exposed to high altitude, when compared to sea-level controls. This study can thus form the basis for identifying biomarkers for diagnostic and prognostic purposes in responses to hypobaric hypoxia.
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