The dilemma of bacterial expansins evolution. The unusual case of Streptomyces acidiscabies and Kutzneria sp. 744

生物 蛋白质组 系统发育树 基因 水平基因转移 扩张素 链霉菌 植物 细菌 生物化学 遗传学 基因表达
作者
Vinicio Armijos‐Jaramillo,Daniela Santander‐Gordón,Eduardo Tejera,Yunierkis Pérez‐Castillo
出处
期刊:Communicative & Integrative Biology [Taylor & Francis]
卷期号:11 (5-6): e1539612-e1539612 被引量:3
标识
DOI:10.1080/19420889.2018.1539612
摘要

Expansins are a superfamily of proteins mainly present in plants that are also found in bacteria, fungi and amoebozoa. Expansin proteins bind the plant cells wall and relax the cellulose microfibrils without any enzymatic action. The evolution of this kind of proteins exposes a complex pattern of horizontal gene transferences that makes difficult to determine the precise origin of non-plant expansins. We performed a genome-wide search of inter-domain horizontal gene transfer events using Streptomyces species and found a plant-like expansin in the Streptomyces acidiscabies proteome. This finding leads us to study in deep the origin and the characteristics of this peculiar protein, also present in the species Kutzneria sp.744. Using phylogenetic analyses, we determine that indeed S. acidiscabies and Kutzneria sp.744 expansins are located inside the plants expansins A clade. Using secondary and tertiary structural information, we observed that the electrostatic potentials and the folding of expansins are similar, independently of the proteins' origin. Using all this information, we conclude that S. acidiscabies and Kutzneria sp.744 expansins have a plant origin but differ from plant and bacterial canonical expansins. This finding suggests that the experimental research around this kind of expansins can be promissory in the future.
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