Whole genome analysis of Enterobacter cloacae Rs-2 and screening of genes related to plant-growth promotion

铁载体 阴沟肠杆菌 生物 基因组 肠杆菌 基因 固氮 生物技术 微生物菌剂 微生物学 遗传学 细菌 肠杆菌科 大肠杆菌
作者
Xiaobo Wang,Zhansheng Wu,Huichun Xiang,Yanhui He,Shuangxi Zhu,Ziyan Zhang,Xueping Li,Jianwen Wang
出处
期刊:Environmental Science and Pollution Research [Springer Science+Business Media]
卷期号:30 (8): 21548-21564 被引量:16
标识
DOI:10.1007/s11356-022-23564-x
摘要

The genus Enterobacter is widely recognized for its biotechnology potential in improving soil environment and crop growth promotion. To further explore these biotechnological potentials, we sequenced and analyzed the whole genome of Enterobacter cloacae Rs-2. The analysis showed that the total length of the Rs-2 genome was 6,965,070,514 bp, and GC content was 55.80%; the annotation results of GO and COG databases showed that the genome contains a variety of growth-promoting genes, such as iscU, glnA, glnB (nitrogen fixation); iucABCD (siderophore synthesis) and fepA, fcuA, fhuA, and pfeA, etc. (siderophore transport); ipdC (secreted IAA) and gcd, pqqBCDEF (dissolved phosphorus), etc. No pathogenic factors such as virulence genes were found. The application of Rs-2 as a soil inoculant in pot experiments showed great potential for growth promotion. This study proved the plant growth-promoting ability of Rs-2 at the molecular level through genetic screening and analysis, which provided guidance for the further improvement of the strain and laid a foundation for its application in agricultural production.
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