Integrated Computational Approach for Designing Potent EGFR‐TK Inhibitors: QSAR, Docking, ADMET, and Molecular Dynamics Studies

药效团 数量结构-活动关系 化学 分子动力学 表皮生长因子受体抑制剂 对接(动物) 表皮生长因子受体 计算生物学 立体化学 组合化学 计算化学 生物化学 受体 生物 医学 护理部
作者
Shital Patil,Kalyani D. Asgaonkar,Shashikant V. Bhandari,Aishwarya M. Edake,Harun Patel,Bhatu Patil,Iqrar Ahmad,Indrani Mahadik,Omkar Kamble,Navnath S. Gavande
出处
期刊:Chemistry & Biodiversity [Wiley]
卷期号:22 (6): e202403150-e202403150 被引量:1
标识
DOI:10.1002/cbdv.202403150
摘要

ABSTRACT The epidermal growth factor receptor (EGFR) regulates cell survival and proliferation, making it a key therapeutic target in cancer. EGFR tyrosine kinase inhibitors (TKIs) block EGFR signaling, preventing uncontrolled cell growth. However, current EGFR‐TKIs face resistance and toxicity issues, necessitating optimized pharmacophores and novel chemical entities (NCEs). This study aimed to develop a 3D quantitative structure–activity relationship (QSAR) model for pharmacophore optimization and to design NCEs with improved properties. In addition, absorption, distribution, metabolism, excretion, and toxicity (ADMET) profiling, molecular docking, and molecular dynamics simulations were performed for the NCEs. Methods: Using Schrödinger's Maestro v13.4, QSAR models were built with 42 thiazolyl‐pyrazoline derivatives, yielding a significant model ( R 2 = 0.7880, Q 2 = 0.7341). Forty NCEs with favorable drug‐like properties were selected. The QikProp module assessed ADMET, while Desmond facilitated 100 ns molecular dynamics simulations. NCE 2 emerged as the top candidate with a docking score of –8.178 kcal/mol, showing strong interaction with Leu 788 in the EGFR binding site. Molecular simulations confirmed the stability of the NCE 2–EGFR complex, with root mean square deviation values between 2.4 and 2.8 Å. NCE 2, a novel thiazolyl‐pyrazoline derivative, demonstrated significant EGFR inhibitory activity, stability, and favorable ADMET properties, making it a promising candidate for further development.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
刚刚
刚刚
弎夜完成签到,获得积分10
刚刚
刚刚
1秒前
红箭烟雨发布了新的文献求助10
2秒前
shiqi完成签到,获得积分10
3秒前
3秒前
充电宝应助傲娇擎汉采纳,获得30
3秒前
4秒前
qinglinglie发布了新的文献求助10
4秒前
KKKK完成签到,获得积分20
4秒前
hhddr完成签到,获得积分20
4秒前
5秒前
李爱国应助笑点低冥采纳,获得10
5秒前
CTT完成签到,获得积分10
6秒前
幸运雨点完成签到,获得积分10
6秒前
6秒前
柠檬u完成签到,获得积分10
6秒前
lili应助小巧的怜晴采纳,获得40
6秒前
7秒前
想想完成签到,获得积分10
7秒前
巅峰囚冰完成签到,获得积分10
7秒前
Mister.WangK完成签到,获得积分10
7秒前
shanshan完成签到,获得积分10
7秒前
sy发布了新的文献求助10
8秒前
可可可不乐完成签到,获得积分10
9秒前
科研小白完成签到,获得积分10
9秒前
热情礼貌一问三不知完成签到 ,获得积分10
9秒前
fengw420完成签到,获得积分10
10秒前
冷傲凝琴发布了新的文献求助10
10秒前
东风应助王道远采纳,获得100
11秒前
MYlin完成签到,获得积分10
11秒前
傻傻的夜柳完成签到 ,获得积分10
11秒前
逆风飞扬发布了新的文献求助20
11秒前
呆鹅喵喵完成签到,获得积分10
11秒前
12秒前
董文慧发布了新的文献求助10
12秒前
13秒前
科目三应助江波采纳,获得10
13秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Les chinois de jakarta: temples et vie collective 1000
Autoparametric Resonance in Mechanical Systems 1000
基于锂离子电池正极材料回收的绿色溶剂开发及工程化应用研究 800
Social Psychology 600
Cosmos as Art Object: Studies in Plato's Timaeus and Other Dialogues 600
Management and the Arts 510
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 内科学 物理 复合材料 催化作用 细胞生物学 无机化学 光电子学 物理化学 电极 基因
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 7646286
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 9218469
关于积分的说明 19779203
捐赠科研通 7210708
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3276988
关于科研通互助平台的介绍 2438629
邀请新用户注册赠送积分活动 2275082