The comparison of cancer gene mutation frequencies in Chinese and U.S. patient populations

癌症 突变 突变率 克拉斯 遗传学 流行病学 基因 医学 人口 肿瘤科 生物 内科学 生物信息学 环境卫生
作者
Fayang Ma,Kyle Vaughn Laster,Zigang Dong
出处
期刊:Nature Communications [Nature Portfolio]
卷期号:13 (1): 5651-5651 被引量:31
标识
DOI:10.1038/s41467-022-33351-4
摘要

Knowing the mutation frequency of cancer genes in China is crucial for reducing the global health burden. We integrate the tumor epidemiological statistics with cancer gene mutation rates identified in 11,948 cancer patients to determine their weighted proportions within a Chinese cancer patient cohort. TP53 (51.4%), LRP1B (13.4%), PIK3CA (11.6%), KRAS (11.1%), EGFR (10.6%), and APC (10.5%) are identified as the top mutated cancer genes in China. Additionally, 18 common cancer types from both China and U.S. cohorts are analyzed and classified into three patterns principally based upon TP53 mutation rates: TP53-Top, TP53-Plus, and Non-TP53. Next, corresponding similarities and prominent differences are identified upon comparing the mutational profiles from both cohorts. Finally, the potential population-specific and environmental risk factors underlying the disparities in cancer gene mutation rates between the U.S. and China are analyzed. Here, we show and compare the mutation rates of cancer genes in Chinese and U.S. population cohorts, for a better understanding of the associated etiological and epidemiological factors, which are important for cancer prevention and therapy.

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