Selection of effective and highly thermostable Bacillus subtilis lipase A template as an industrial biocatalyst-A modern computational approach

作者
senthilkumar Senthilkumar,Meshachpaul,Rao,Sethumadhavan,Rajasekaran
出处
期刊:Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Sunyatseni 卷期号: (6): 508-519
摘要

Biocatalysts 是内在地反应的,因此他们的运作的稳定性具有为任何 bioprocess 的重要意义。在 biocatalyst 稳定性的挫折从多样的前景被处理了。内在地,稳定的 biocatalysts 显著地被认识到,一次常规尝试正在被做搜寻收留他们的新有机体。这里,我们用 conformational 采样技术计算地分析了杆菌 subtilis 和它的六 thermostable 异种(2M, 3M, 4M, 6M, 9M 和 12M ) 的工业 biocatalyst 脂肪分解酵素 A (土著人) 。因而,译解的各种各样的结构的事件象根平均数平方偏差,根平均数平方变化,旋转的半径和极的表面区域一样的 thermostability 显示了变异的 12M 与统计确认高度稳定。而且,包含 intra 分子的相互作用,第二等的结构,溶剂可接近性,氢契约模式,模仿的热变性作用和 desolvation 精力的静态的模型分析也比较地支持了 12M。笔记,高第二等的结构的刚硬和氢契约的存在增加了 12M 的 thermostability 和功能,因此为在未来设计 thermostable 脂肪分解酵素作为一个最好的模板选择它。另外,这研究在酶催化作用和酶工程向 conformational 采样的更好的理解有一个重要含意。

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