Flavobacterium taihuense sp. nov., a bacterium isolated from lake sediment

生物 16S核糖体RNA 黄杆菌 系统发育树 细菌 黄杆菌科 基因组DNA 微生物学 拉伤 化学分类学 系统发育学 核糖体RNA 植物 拟杆菌 基因 分类学(生物学) 生物化学 遗传学 假单胞菌 解剖
作者
Bang-Bang Yang,Bowen Ma,Jia Zhou,Wenwen Ma,Yu Luo,Jian-Hang Qu
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:72 (6) 被引量:4
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.005432
摘要

A novel bacterium, designated NAS39T, was isolated from the interfacial sediment of Taihu Lake in PR China and its taxonomic position was investigated by using a polyphasic approach. Cells of the isolate were Gram-stain-negative, aerobic, non-motile, catalase-positive, yellow and rod-shaped. Phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene sequences supported that strain NAS39T formed a cluster within the genus Flavobacterium, and was most closely related to Flavobacterium laiguense LB2P30T (98.4 %), followed by Flavobacterium tiangeerense 0563T (97.4 %). The average nucleotide identity values between strain NAS39T and F. laiguense LB2P30T and F. tiangeerense 0563T were 82.5 and 75.3 %, respectively. The digital DNA-DNA hybridization values between strain NAS39T and F. laiguense LB2P30T and F. tiangeerense 0563T were 40.9 and 18.6 %, respectively. The genomic DNA G+C content was 34.1 mol%. The major respiratory quinone was menaquinone-6. The dominant cellular fatty acids were iso-C15 : 0 and summed feature 3 comprising C16 : 1 ω7c/C16 : 1 ω6c. The polar lipids comprised phosphatidyl ethanolamine, two amino lipids, three amino phospholipids and two unidentified lipids. Based on the phenotypic, chemotaxonomic, genotypic and phylogenetic characteristics, strain NAS39T (=MCCC 1K06094T=KACC 22328T) represents a novel species of the genus Flavobacterium, for which the name Flavobacterium taihuense sp. nov. is proposed.

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