Comprehensive analysis of differences of N 6 -methyladenosine RNA methylomes between high-fat-fed and normal mouse livers

生物 N6-甲基腺苷 甲基化 核糖核酸 基因 DNA甲基化 遗传学 计算生物学 分子生物学 DNA 基因表达 甲基转移酶
作者
Zupeng Luo,Zhiwang Zhang,Lina Tai,Lifang Zhang,Zheng Sun,Lei Zhou
出处
期刊:Epigenomics [Future Medicine]
卷期号:11 (11): 1267-1282 被引量:74
标识
DOI:10.2217/epi-2019-0009
摘要

Aim: To assess the m6A methylome in mouse fatty liver induced by a high-fat diet (HFD). Materials & methods: MeRIP-seq was performed to identify differences in the m6A methylomes between the normal liver and fatty liver induced by an HFD. Results: As compared with the control group, the upmethylated coding genes upon feeding an HFD were primarily enriched in processes associated with lipid metabolism, while genes with downmethylation were enriched in processes associated with metabolism and translation. Furthermore, many RNA-binding proteins that potentially bind to differentially methylated m6A sites were mainly annotated in processes of RNA splicing. Conclusion: These findings suggest that differential m6A methylation may act on functional genes through RNA-binding proteins to regulate the metabolism of lipids in fatty liver disease.
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