Computational study for suppression of CD25/IL-2 interaction

白细胞介素2受体 小干扰RNA 生物信息学 免疫系统 癌症研究 体内 计算生物学 生物 化学 细胞生物学 免疫学 T细胞 核糖核酸 遗传学 基因
作者
Moein Dehbashi,Zohreh Hojati,Majid Motovali-Bashi,Mazdak Ganjalıkhani-Hakemi,Akihiro Shimosaka,William C. Cho
出处
期刊:Biological Chemistry [De Gruyter]
卷期号:402 (2): 167-178
标识
DOI:10.1515/hsz-2020-0326
摘要

Abstract Cancer recurrence presents a huge challenge in cancer patient management. Immune escape is a key mechanism of cancer progression and metastatic dissemination. CD25 is expressed in regulatory T (Treg) cells including tumor-infiltrating Treg cells (TI-Tregs). These cells specially activate and reinforce immune escape mechanism of cancers. The suppression of CD25/IL-2 interaction would be useful against Treg cells activation and ultimately immune escape of cancer. Here, software, web servers and databases were used, at which in silico designed small interfering RNAs (siRNAs), de novo designed peptides and virtual screened small molecules against CD25 were introduced for the prospect of eliminating cancer immune escape and obtaining successful treatment. We obtained siRNAs with low off-target effects. Further, small molecules based on the binding homology search in ligand and receptor similarity were introduced. Finally, the critical amino acids on CD25 were targeted by a de novo designed peptide with disulfide bond. Hence we introduced computational-based antagonists to lay a foundation for further in vitro and in vivo studies.
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