Dissecting the multicellular ecosystem of metastatic melanoma by single-cell RNA-seq

生物 基因表达 细胞 基因 抗药性 核糖核酸 RNA序列 转录组 癌症研究 黑色素瘤 多细胞生物 遗传学 计算生物学
作者
Itay Tirosh,Benjamin Izar,Sanjay M. Prakadan,Marc H. Wadsworth,Daniel J. Treacy,John J. Trombetta,Asaf Rotem,Christopher Rodman,Christine G. Lian,Gëorge F. Murphy,Mohammad Fallahi-Sichani,Ken Dutton‐Regester,Jia-Ren Lin,Ofir Cohen,Parin Shah,Diana Lu,Alex S. Genshaft,Travis Hughes,Carly G. K. Ziegler,Samuel W. Kazer,Aleth Gaillard,Kellie E. Kolb,Alexandra Chloé Villani,Cory M. Johannessen,Aleksandr Andreev,Eliezer M. Van Allen,Monica M. Bertagnolli,Peter K. Sorger,Ryan J. Sullivan,Keith T. Flaherty,Dennie T. Frederick,Judit Jané‐Valbuena,Charles H. Yoon,Orit Rozenblatt-Rosen,Alex K. Shalek,Aviv Regev,Levi A. Garraway
出处
期刊:Science [American Association for the Advancement of Science (AAAS)]
卷期号:352 (6282): 189-196 被引量:3478
标识
DOI:10.1126/science.aad0501
摘要

Single-cell expression profiles of melanoma Tumors harbor multiple cell types that are thought to play a role in the development of resistance to drug treatments. Tirosh et al. used single-cell sequencing to investigate the distribution of these differing genetic profiles within melanomas. Many cells harbored heterogeneous genetic programs that reflected two different states of genetic expression, one of which was linked to resistance development. Following drug treatment, the resistance-linked expression state was found at a much higher level. Furthermore, the environment of the melanoma cells affected their gene expression programs. Science , this issue p. 189
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