Role of GxxxG Motifs in Transmembrane Domain Interactions

跨膜结构域 跨膜蛋白 生物物理学 结构母题 膜蛋白 化学 蛋白质折叠 蛋白质结构 蛋白质-蛋白质相互作用 主题(音乐) 计算生物学 生物化学 生物 物理 受体 声学
作者
Mark G. Teese,Dieter Langosch
出处
期刊:Biochemistry [American Chemical Society]
卷期号:54 (33): 5125-5135 被引量:169
标识
DOI:10.1021/acs.biochem.5b00495
摘要

Transmembrane (TM) helices of integral membrane proteins can facilitate strong and specific noncovalent protein–protein interactions. Mutagenesis and structural analyses have revealed numerous examples in which the interaction between TM helices of single-pass membrane proteins is dependent on a GxxxG or (small)xxx(small) motif. It is therefore tempting to use the presence of these simple motifs as an indicator of TM helix interactions. In this Current Topic review, we point out that these motifs are quite common, with more than 50% of single-pass TM domains containing a (small)xxx(small) motif. However, the actual interaction strength of motif-containing helices depends strongly on sequence context and membrane properties. In addition, recent studies have revealed several GxxxG-containing TM domains that interact via alternative interfaces involving hydrophobic, polar, aromatic, or even ionizable residues that do not form recognizable motifs. In multipass membrane proteins, GxxxG motifs can be important for protein folding, and not just oligomerization. Our current knowledge thus suggests that the presence of a GxxxG motif alone is a weak predictor of protein dimerization in the membrane.
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