Integrated analysis of the functions of RNA binding proteins in clear cell renal cell carcinoma

生物 肾透明细胞癌 RNA结合蛋白 恶性肿瘤 计算生物学 肾细胞癌 表型 核糖核酸 基因 生物信息学 肿瘤科 遗传学 医学
作者
Xiaoliang Hua,Juan Chen,Shengdong Ge,Haibing Xiao,Li Zhang,Chang Yin Liang
出处
期刊:Genomics [Elsevier BV]
卷期号:113 (1): 850-860 被引量:5
标识
DOI:10.1016/j.ygeno.2020.10.016
摘要

RNA binding proteins (RBPs) dysregulation is involved in the processes of various tumors. However, the roles of RBPs in clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) remain poorly understand. In present study, we first performed consensus clustering and identified two clusters, of which cluster 2 was closely correlated with the malignancy of ccRCC. Differentially expressed RBPs between normal and tumor tissues were obtained, comprising 71 up-regulated and 44 down-regulated ones. Then, ten hub genes were selected and validated using The Human Protein Atlas database and receiver operating characteristic curves, showing good diagnostic value for cancers. Besides, we identified ten RBPs with the most useful prognostic values, and were used to construct a risk score model. The model could be used to stratify patients with different prognosis and phenotype distributions. The model showed good performance and can be used as a complementation for clinical factors to guide clinical practice in the future.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
琪琪的发布了新的文献求助10
1秒前
HuanchuWang完成签到 ,获得积分10
2秒前
木头完成签到,获得积分10
3秒前
kannar完成签到,获得积分10
6秒前
情怀应助ShiRz采纳,获得10
8秒前
地狱跳跳虎完成签到 ,获得积分10
8秒前
9秒前
Amo完成签到,获得积分10
9秒前
开放飞阳完成签到,获得积分10
10秒前
11秒前
可爱的函函应助积极芷容采纳,获得10
11秒前
星辰大海应助积极的明天采纳,获得10
12秒前
pazuzu发布了新的文献求助10
13秒前
逍遥自在完成签到,获得积分10
13秒前
秋天完成签到,获得积分10
15秒前
16秒前
林qjr发布了新的文献求助20
23秒前
不懈奋进应助默默的鬼神采纳,获得60
23秒前
pazuzu完成签到,获得积分10
25秒前
科目三应助溶胶采纳,获得10
25秒前
27秒前
30秒前
Zz发布了新的文献求助10
31秒前
番茄炒蛋发布了新的文献求助10
31秒前
澄子完成签到 ,获得积分10
34秒前
星黛露发布了新的文献求助10
34秒前
35秒前
科研通AI5应助琪琪的采纳,获得10
36秒前
李健应助笑点低的文轩采纳,获得10
36秒前
Drjason驳回了Whim应助
36秒前
pluto应助加减乘除采纳,获得10
38秒前
guanze发布了新的文献求助10
40秒前
42秒前
Lina完成签到 ,获得积分10
43秒前
44秒前
feng完成签到,获得积分10
44秒前
吼吼完成签到,获得积分10
44秒前
44秒前
笑点低的文轩完成签到,获得积分20
45秒前
林qjr完成签到,获得积分10
45秒前
高分求助中
【此为提示信息,请勿应助】请按要求发布求助,避免被关 20000
ISCN 2024 – An International System for Human Cytogenomic Nomenclature (2024) 3000
Continuum Thermodynamics and Material Modelling 2000
Encyclopedia of Geology (2nd Edition) 2000
105th Edition CRC Handbook of Chemistry and Physics 1600
Maneuvering of a Damaged Navy Combatant 650
Mindfulness and Character Strengths: A Practitioner's Guide to MBSP 380
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 物理 生物化学 纳米技术 计算机科学 化学工程 内科学 复合材料 物理化学 电极 遗传学 量子力学 基因 冶金 催化作用
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3776783
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3322186
关于积分的说明 10209239
捐赠科研通 3037436
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1666696
邀请新用户注册赠送积分活动 797627
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 757959