DeePMD-kit v3: A Multiple-Backend Framework for Machine Learning Potentials

计算机科学 人机交互 数据科学
作者
Jinzhe Zeng,Duo Zhang,Anyang Peng,Xiangyu Zhang,S Z He,Yan Wang,Xinzijian Liu,Hangrui Bi,Yifan Li,Chun Cai,Chengqian Zhang,Yiming Du,Jiaxin Zhu,Pinghui Mo,Zhengtao Huang,Qiyu Zeng,Shaochen Shi,Xuejian Qin,Zhaoxi Yu,Chenxing Luo
出处
期刊:Journal of Chemical Theory and Computation [American Chemical Society]
卷期号:21 (9): 4375-4385 被引量:51
标识
DOI:10.1021/acs.jctc.5c00340
摘要

In recent years, machine learning potentials (MLPs) have become indispensable tools in physics, chemistry, and materials science, driving the development of software packages for molecular dynamics (MD) simulations and related applications. These packages, typically built on specific machine learning frameworks, such as TensorFlow, PyTorch, or JAX, face integration challenges when advanced applications demand communication across different frameworks. The previous TensorFlow-based implementation of the DeePMD-kit exemplified these limitations. In this work, we introduce DeePMD-kit version 3, a significant update featuring a multibackend framework that supports TensorFlow, PyTorch, JAX, and PaddlePaddle backends, and demonstrate the versatility of this architecture through the integration of other MLP packages and of differentiable molecular force fields. This architecture allows seamless back-end switching with minimal modifications, enabling users and developers to integrate DeePMD-kit with other packages using different machine learning frameworks. This innovation facilitates the development of more complex and interoperable workflows, paving the way for broader applications of MLPs in scientific research.
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