Measuring Stress Phenotypes in Cryptococcus neoformans

新生隐球菌 生物 隐球菌 表型 基因 遗传学 模式生物 突变 拉伤 酵母 突变体 计算生物学 微生物学 解剖
作者
Rajendra Upadhya,Corinna Probst,J. Andrew Alspaugh,Jennifer K. Lodge
出处
期刊:Methods in molecular biology [Springer Science+Business Media]
卷期号:: 277-303
标识
DOI:10.1007/978-1-0716-3722-7_19
摘要

Cryptococcus neoformans is an opportunistic human fungal pathogen capable of surviving in a wide range of environments and hosts. It has been developed as a model organism to study fungal pathogenesis due to its fully sequenced haploid genome and optimized gene deletion and mutagenesis protocols. These methods have greatly aided in determining the relationship between Cryptococcus genotype and phenotype. Furthermore, the presence of congenic mata and matα strains associated with a defined sexual cycle has helped further understand cryptococcal biology. Several in vitro stress conditions have been optimized to closely mimic the stress that yeast encounter in the environment or within the infected host. These conditions have proven to be extremely useful in elucidating the role of several genes in allowing yeast to adapt and survive in hostile external environments. This chapter describes various in vitro stress conditions that could be used to test the sensitivity of different mutant strains, as well as the protocol for preparing them. We have also included a list of mutants that could be used as a positive control strain when testing the sensitivity of the desired strain to a specific stress.
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