A Method for Inferring Polymers Based on Linear Regression and Integer Programming

整数规划 整数(计算机科学) 分支机构和价格 线性回归 回归 计算机科学 数学 数学优化 统计 程序设计语言
作者
Ryota Ido,Shengjuan Cao,Jianshen Zhu,Naveed Ahmed Azam,Kazuya Haraguchi,Liang Zhao,Hiroshi Nagamochi,Tatsuya Akutsu
出处
期刊:IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics [Institute of Electrical and Electronics Engineers]
卷期号:21 (6): 1623-1632 被引量:4
标识
DOI:10.1109/tcbb.2024.3447780
摘要

A novel framework has recently been proposed for designing the molecular structure of chemical compounds with a desired chemical property using both artificial neural networks and mixed integer linear programming. In this paper, we design a new method for inferring a polymer based on the framework. For this, we introduce a new way of representing a polymer as a form of monomer and define new descriptors that feature the structure of polymers. We also use linear regression as a building block of constructing a prediction function in the framework. The results of our computational experiments reveal a set of chemical properties on polymers to which a prediction function constructed with linear regression performs well. We also observe that the proposed method can infer polymers with up to 50 nonhydrogen atoms in a monomer form.

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