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Autonomous, multi-property-driven molecular discovery: from predictions to measurements and back

化学空间 财产(哲学) 计算机科学 功能(生物学) 空格(标点符号) 亲脂性 生物系统 纳米技术 人工智能 药物发现 化学 材料科学 生物 进化生物学 认识论 操作系统 哲学 有机化学 生物化学
作者
Brent A. Koscher,Richard B. Canty,Matthew A. McDonald,Kevin P. Greenman,Charles J. McGill,Camille L. Bilodeau,Wengong Jin,Haoyang Wu,Florence H. Vermeire,Brooke Jin,Travis Hart,Timothy Kulesza,Shih‐Cheng Li,Tommi Jaakkola,Regina Barzilay,Rafael Gómez‐Bombarelli,William H. Green,Klavs F. Jensen
标识
DOI:10.26434/chemrxiv-2023-r7b01
摘要

A closed-loop, autonomous molecular discovery platform driven by integrated machine learning tools was developed to accelerate the design of molecules with desired properties. Two case studies are demonstrated on dye-like molecules, targeting absorption wavelength, lipophilicity, and photo-oxidative stability. In the first, the platform experimentally realized 312 unreported molecules across three automatic iterations of molecular design-make-test-analyze cycles while exploring the structure–function space of four rarely reported scaffolds. In each iteration, the property-prediction models which guided the exploration learned the structure–property space of diverse inexpensive scaffold derivatives realized through using multi-step syntheses. Conversely, the second study exploited property models trained on a chemical space with pre-existing examples to discover 6 top-performing molecules within the structure-property space. By closing the molecular discovery cycle of prediction, synthesis, measurement, and model retraining, the platform demonstrates the potential for integrated platforms to automatically understand a local chemical space and discover functional molecules.
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