Enabling Lipidomic Biomarker Studies for Protected Populations by Combining Noninvasive Fingerprint Sampling with MS Analysis and Machine Learning

生物标志物发现 生物标志物 指纹(计算) 脂类学 计算生物学 计算机科学 疾病 采样(信号处理) 血液取样 人工智能 机器学习 生物信息学 生物 医学 蛋白质组学 病理 内科学 遗传学 滤波器(信号处理) 基因 计算机视觉
作者
Madeline Isom,Eden P. Go,Heather Desaire
出处
期刊:Journal of Proteome Research [American Chemical Society]
卷期号:23 (8): 2805-2814 被引量:4
标识
DOI:10.1021/acs.jproteome.3c00368
摘要

Triacylglycerols and wax esters are two lipid classes that have been linked to diseases, including autism, Alzheimer's disease, dementia, cardiovascular disease, dry eye disease, and diabetes, and thus are molecules worthy of biomarker exploration studies. Since triacylglycerols and wax esters make up the majority of skin-surface lipid secretions, a viable sampling method for these potential biomarkers would be that of groomed latent fingerprints. Currently, however, blood-based sampling protocols predominate in the field. The invasiveness of a blood draw limits its utility to protected populations, including children and the elderly. Herein we describe a noninvasive means for sample collection (from fingerprints) paired with fast MS data-acquisition (MassIVE data set MSV000092742) and efficient data analysis via machine learning. Using both supervised and unsupervised classification, we demonstrate the usefulness of this method in determining whether a variable of interest imparts measurable change within the lipidomic data set. As a proof-of-concept, we show that the method is capable of distinguishing between the fingerprints of different individuals as well as between anatomical sebum collection regions. This noninvasive, high-throughput approach enables future lipidomic biomarker researchers to more easily include underrepresented, protected populations, such as children and the elderly, thus moving the field closer to definitive disease diagnoses that apply to all.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
1秒前
2秒前
666完成签到 ,获得积分10
3秒前
461107176发布了新的文献求助10
4秒前
白英完成签到,获得积分10
5秒前
跳跃惜筠发布了新的文献求助10
5秒前
5秒前
ccc完成签到,获得积分10
6秒前
7秒前
思源应助买丽克采纳,获得10
8秒前
Limo发布了新的文献求助10
9秒前
金鑫发布了新的文献求助10
9秒前
ymy发布了新的文献求助10
9秒前
所所应助Hao采纳,获得10
12秒前
12秒前
大壮完成签到,获得积分10
13秒前
逝水流年完成签到,获得积分10
13秒前
14秒前
大壮发布了新的文献求助10
16秒前
16秒前
大个应助joy采纳,获得10
16秒前
李健的小迷弟应助joy采纳,获得10
16秒前
Limo完成签到,获得积分10
18秒前
18秒前
水孩子完成签到,获得积分10
18秒前
儒雅的城完成签到,获得积分10
19秒前
19秒前
20秒前
20秒前
在水一方应助hanwy采纳,获得10
22秒前
24秒前
买丽克发布了新的文献求助10
24秒前
天天发布了新的文献求助30
25秒前
27秒前
传奇3应助专注月亮采纳,获得10
27秒前
jjy完成签到,获得积分10
28秒前
childe完成签到,获得积分10
29秒前
31秒前
插线板完成签到 ,获得积分10
32秒前
111发布了新的文献求助10
32秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
HYDROLYSE ACIDE DE QUELQUES DIOXASPIROCYCLANES 1314
Essentials of Carbohydrate Chemistry and Biochemistry, 4th Edition 800
Navigating Normative Orders. Interdisciplinary Perspectives 800
1 Peter and Christ's Descent to the Dead in Its Early Christian Reception 700
A Psychological Understanding of Criticism and Mental Health 600
Organizational Behavior 510
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 内科学 物理 复合材料 催化作用 细胞生物学 无机化学 光电子学 物理化学 电极 基因
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 7751127
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 9298494
关于积分的说明 20246706
捐赠科研通 7333241
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3309788
关于科研通互助平台的介绍 2461346
邀请新用户注册赠送积分活动 2322356