Enabling Lipidomic Biomarker Studies for Protected Populations by Combining Noninvasive Fingerprint Sampling with MS Analysis and Machine Learning

生物标志物发现 生物标志物 指纹(计算) 脂类学 计算生物学 计算机科学 疾病 采样(信号处理) 血液取样 痴呆 人工智能 机器学习 生物信息学 生物 医学 蛋白质组学 病理 内科学 遗传学 滤波器(信号处理) 基因 计算机视觉
作者
Madeline Isom,Eden P. Go,Heather Desaire
出处
期刊:Journal of Proteome Research [American Chemical Society]
标识
DOI:10.1021/acs.jproteome.3c00368
摘要

Triacylglycerols and wax esters are two lipid classes that have been linked to diseases, including autism, Alzheimer’s disease, dementia, cardiovascular disease, dry eye disease, and diabetes, and thus are molecules worthy of biomarker exploration studies. Since triacylglycerols and wax esters make up the majority of skin-surface lipid secretions, a viable sampling method for these potential biomarkers would be that of groomed latent fingerprints. Currently, however, blood-based sampling protocols predominate in the field. The invasiveness of a blood draw limits its utility to protected populations, including children and the elderly. Herein we describe a noninvasive means for sample collection (from fingerprints) paired with fast MS data-acquisition (MassIVE data set MSV000092742) and efficient data analysis via machine learning. Using both supervised and unsupervised classification, we demonstrate the usefulness of this method in determining whether a variable of interest imparts measurable change within the lipidomic data set. As a proof-of-concept, we show that the method is capable of distinguishing between the fingerprints of different individuals as well as between anatomical sebum collection regions. This noninvasive, high-throughput approach enables future lipidomic biomarker researchers to more easily include underrepresented, protected populations, such as children and the elderly, thus moving the field closer to definitive disease diagnoses that apply to all.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
3秒前
Ted完成签到,获得积分10
3秒前
6秒前
8秒前
呆呆羔羊完成签到 ,获得积分10
12秒前
顺利向彤完成签到,获得积分20
12秒前
科研入门小萌新完成签到,获得积分10
12秒前
丘比特应助顺利的雅柔采纳,获得10
14秒前
16秒前
追风少年发布了新的文献求助10
17秒前
Hello应助沉静的元容采纳,获得10
22秒前
健壮雨兰完成签到,获得积分10
25秒前
ntrip完成签到,获得积分10
25秒前
大个应助陶醉的老鼠采纳,获得10
25秒前
27秒前
28秒前
xiyu发布了新的文献求助10
32秒前
32秒前
深情安青应助冲冲冲采纳,获得10
33秒前
36秒前
桐桐应助顺利的雅柔采纳,获得10
42秒前
孤独听雨的猫完成签到,获得积分10
43秒前
49秒前
llsssyy发布了新的文献求助10
52秒前
烟花应助科研通管家采纳,获得10
54秒前
小马甲应助科研通管家采纳,获得10
54秒前
情怀应助科研通管家采纳,获得10
54秒前
SciGPT应助科研通管家采纳,获得10
54秒前
秋雪瑶应助科研通管家采纳,获得10
54秒前
54秒前
凤凰应助科研通管家采纳,获得30
54秒前
脑洞疼应助科研通管家采纳,获得10
55秒前
汉堡包应助科研通管家采纳,获得10
55秒前
小七啊发布了新的文献求助10
55秒前
56秒前
画船听雨眠完成签到 ,获得积分10
59秒前
zzj1904完成签到,获得积分20
59秒前
QZ发布了新的文献求助10
1分钟前
1分钟前
林一完成签到,获得积分20
1分钟前
高分求助中
请在求助之前详细阅读求助说明!!!! 20000
Sphäroguß als Werkstoff für Behälter zur Beförderung, Zwischen- und Endlagerung radioaktiver Stoffe - Untersuchung zu alternativen Eignungsnachweisen: Zusammenfassender Abschlußbericht 1500
One Man Talking: Selected Essays of Shao Xunmei, 1929–1939 1000
Yuwu Song, Biographical Dictionary of the People's Republic of China 700
[Lambert-Eaton syndrome without calcium channel autoantibodies] 520
The Three Stars Each: The Astrolabes and Related Texts 500
india-NATO Dialogue: Addressing International Security and Regional Challenges 400
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 有机化学 工程类 生物化学 纳米技术 物理 内科学 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 电极 光电子学 量子力学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 2469729
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2136874
关于积分的说明 5444504
捐赠科研通 1861262
什么是DOI,文献DOI怎么找? 925691
版权声明 562702
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 495140