Complete genome analysis of copper resistant bacteria Pseudoalteromonas sp. CuT4–3 isolated from a deep-sea hydrothermal vent

生物 γ蛋白杆菌 基因 假交替单胞菌 细菌 基因组 全基因组测序 深海热液喷口 GC含量 质粒 遗传学 微生物学 16S核糖体RNA 热液循环 古生物学
作者
Bowen Ji,Tong Yu,Xiang Zeng
出处
期刊:Marine Genomics [Elsevier BV]
卷期号:75: 101106-101106 被引量:1
标识
DOI:10.1016/j.margen.2024.101106
摘要

Pseudoalteromonas sp. CuT4–3, a copper resistant bacterium, was isolated from deep-sea hydrothermal sulfides on the Southwest Indian Ridge (SWIR), is an aerobic, mesophilic and rod-shaped bacterium belonging to the family Pseudoalteromonadaceae (class Gammaproteobacteria, order Alteromonadales). In this study, we present the complete genome sequence of strain CuT4–3, which consists of a single circular chromosome comprising 3,660,538 nucleotides with 41.05% G + C content and two circular plasmids comprising 792,064 nucleotides with 40.36% G + C content and 65,436 nucleotides with 41.50% G + C content. In total, 4078 protein coding genes, 105 tRNA genes, and 25 rRNA genes were obtained. Genomic analysis of strain CuT4–3 identified numerous genes related to heavy metal resistance (especially copper) and EPS production. The genome of strain CuT4–3 will be helpful for further understanding of its adaptive strategies, particularly its ability to resist heavy metal, in the deep-sea hydrothermal vent environment.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
lxl98完成签到,获得积分10
刚刚
科研通AI5应助Zxy采纳,获得10
刚刚
酷波er应助linhanwenzhou采纳,获得10
1秒前
222发布了新的文献求助10
2秒前
2秒前
3秒前
科研通AI5应助dai采纳,获得10
3秒前
lierikafei发布了新的文献求助10
3秒前
尛瞐慶成发布了新的文献求助10
3秒前
丘比特应助lxl98采纳,获得10
4秒前
5秒前
Yey完成签到 ,获得积分10
6秒前
zzrg发布了新的文献求助10
7秒前
7秒前
8秒前
8秒前
顾矜应助小绿茶采纳,获得10
9秒前
10秒前
linhanwenzhou完成签到,获得积分10
11秒前
11秒前
LSJ完成签到,获得积分10
12秒前
NexusExplorer应助俭朴的滑板采纳,获得10
13秒前
14秒前
情怀应助zzrg采纳,获得10
14秒前
14秒前
科研通AI5应助忧子忘采纳,获得10
16秒前
16秒前
linhanwenzhou发布了新的文献求助10
17秒前
bkagyin应助研友_LwlRen采纳,获得10
17秒前
虚幻幻翠发布了新的文献求助10
17秒前
现代的大山完成签到,获得积分10
18秒前
852应助无私甜瓜采纳,获得10
19秒前
薛wen晶完成签到 ,获得积分10
20秒前
222完成签到,获得积分10
20秒前
bbb发布了新的文献求助10
22秒前
pp完成签到 ,获得积分10
22秒前
慕青应助破风老司机采纳,获得10
22秒前
NexusExplorer应助Liam采纳,获得10
22秒前
陆吉完成签到,获得积分10
23秒前
甜甜玫瑰应助VVhahaha采纳,获得10
23秒前
高分求助中
Encyclopedia of Mathematical Physics 2nd edition 888
Technologies supporting mass customization of apparel: A pilot project 600
材料概论 周达飞 ppt 500
Nonrandom distribution of the endogenous retroviral regulatory elements HERV-K LTR on human chromosome 22 500
Introduction to Strong Mixing Conditions Volumes 1-3 500
Optical and electric properties of monocrystalline synthetic diamond irradiated by neutrons 320
科学教育中的科学本质 300
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 物理 生物化学 纳米技术 计算机科学 化学工程 内科学 复合材料 物理化学 电极 遗传学 量子力学 基因 冶金 催化作用
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3806839
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3351563
关于积分的说明 10354783
捐赠科研通 3067340
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1684500
邀请新用户注册赠送积分活动 809737
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 765635