In-silico identification of inhibitors for controlling rice blast

格里斯麦格纳波特 附着胞 麦格纳波特 生物信息学 真菌 爆发性疾病 生物 水稻 计算生物学 植物 生物化学 水稻 基因 农学
作者
Amrender Kumar,Anurag Mishra,Ajay Jain
出处
期刊:International Conference on Computing for Sustainable Global Development 卷期号:: 1888-1892 被引量:3
链接
摘要

Rice blast is one of the most important disease of the rice worldwide, caused by a fungus Magnaporthe grisea, a plant pathogen. This fungus produces a specialized structure, called appressorium infecting the plant. Melanin is a necessary for appressorium functioning in M. grisea. Two enzymes of melanin pathway, THNR and SDH, are used as drug targets against rice blast to inhibit the melanin pathway which is responsible for appressorium formation. In this study, we have found various compounds from the ZINC database against the proteins THNR and SDH of Magnaporthe grisea. Our analysis have reported 1000 Lipinski compliant hits which on docking, identified structurally novel ligands that will make similar interactions with known targets or non similar interactions with other binding site parts. We identified four novel compounds, viz. ZINC47622465, ZINC70932033, ZINC09011974 and ZINC66511493 with idock score of −12.594, −12.546, and −12.109 & −12.421 kcal/mol, respectively. This study aims to identify new inhibitors which can be used as potential anti-fungal compounds for controlling rice blast.

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