Clinicopathological and molecular landscape of 5-year IDH-wild-type glioblastoma survivors: A multicentric retrospective study

异柠檬酸脱氢酶 CpG站点 DNA甲基化 甲基化 胶质瘤 肿瘤科 生物 发起人 拷贝数变化 医学 癌症研究 基因 遗传学 基因表达 基因组 生物化学
作者
Evelina Miele,Elena Anghileri,Chiara Calatozzolo,Elisabetta Lazzarini,Sara Patrizi,Andrea Ciolfi,Lucia Pedace,Monica Patanè,Luana Abballe,Rosina Paterra,L Maddaloni,Sabina Barresi,Angela Mastronuzzi,Alessandra Petruzzi,Irene Tramacere,Mariangela Farinotti,Lorena Gurrieri,Elena Pirola,Mauro Scarpelli,Giuseppe Lombardi
出处
期刊:Cancer Letters [Elsevier BV]
卷期号:588: 216711-216711 被引量:3
标识
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216711
摘要

Five-year glioblastoma (GBM) survivors (LTS) are the minority of the isocitrate dehydrogenase (IDH)-wild-type GBM patients, and their molecular fingerprint is still largely unexplored. This multicenter retrospective study analyzed a large LTS-GBM cohort from nine Italian institutions and molecularly characterized a subgroup of patients by mutation, DNA methylation (DNAm) and copy number variation (CNV) profiling, comparing it to standard survival GBM. Mutation scan allowed the identification of pathogenic variants in most cases, showing a similar mutational spectrum in both groups, and highlighted TP53 as the most commonly mutated gene in the LTS group. We confirmed DNAm as a valuable tool for GBM classification with a diagnostic refinement by using brain tumor classifier v12.5. LTS were more heterogeneous with more cases classified as diffuse pediatric high-grade glioma subtypes and having peculiar CNVs. We observed a global higher methylation in CpG islands and in gene promoters of LTS with methylation levels of distinct gene promoters correlating with prognosis.
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