Development of a skin microbiome diagnostic method to assess skin condition in healthy individuals: Application of research on skin microbiomes and skin condition

微生物群 主成分分析 生物 人体皮肤 敏感皮肤 皮肤病科 医学 生物信息学 遗传学 人工智能 计算机科学
作者
Yuki Kotakeyama,Rie Nakamura,Masaharu Kurosawa,Seiko Ota,Ruka Suzuki,Miki Nakanishi,Kohei Kanno,Kosuke Watanabe,Yukiko Ishitsuka
出处
期刊:International Journal of Cosmetic Science [Wiley]
卷期号:43 (6): 677-690 被引量:4
标识
DOI:10.1111/ics.12744
摘要

Skin microbiomes vary across individuals. They are known to play essential roles in maintaining homeostasis and preventing infectious pathogens. In recent years, cosmetic product development has begun to focus on the relationship between skin microbiomes and skin conditions. However, the statistical methods used in many studies include the standard t-test and small-scale correlation analysis, which do not take into account the internal correlation structure in data on skin microbiomes and skin features. In this study, we aimed to understand the relationship between skin microbiomes and skin features by analysing complex microbiomes and skin data.We obtained data on 19 skin characteristics and skin microbiomes based on 16s ribosomal RNA (16S rRNA) gene analysis of 276 healthy Japanese women. We then performed the principal component analysis (PCA), a method that takes into account the internal correlation structure, on 234 panels of them that did not contain outliers or missing values. We confirmed the relationship between skin microbiomes and skin features with principal component regression analysis and hierarchical clustering analysis (HCA).The principal component regression analysis showed strong relationships between skin microbiomes and sebum-related skin characteristics and skin pH. In the HCA, the female panel was classified into two major groups based on the skin microbiome. Furthermore, there were significant differences in sebum-related skin characteristics and the way skin condition changes with ageing between those groups, suggesting the possibility of measuring skin condition and age-related skin risk based on microbiome data. In addition, sebum-related characteristics differed significantly among middle-aged participants, suggesting a strong relationship between skin microbiomes and sebum-related characteristics.Analysis of skin condition and skin microbiome in Japanese women, taking into account the correlation between variables, showed that skin microbiome was significantly related to the number of pores and the amount of sebum. Furthermore, it was suggested that the skin condition and the way the skin condition changes with ageing may differ depending on the type of skin microbiome. The finding of a relationship between skin condition and skin microbiome suggests the possibility of proposing a new beauty method focusing on the skin microbiome in the future.Les microbiomes de la peau varient selon les individus. Ils sont connus pour jouer des rôles essentiels dans le maintien de l'homéostasie et la prévention des agents pathogènes infectieux. Ces dernières années, le développement de produits cosmétiques a commencé à se concentrer sur la relation entre les microbiomes cutanés et les conditions de la peau. Cependant, les méthodes statistiques utilisées dans de nombreuses études comprennent le t-test standard et l'analyse de corrélation à petite échelle, qui ne tiennent pas compte de la structure de corrélation interne dans les données sur les microbiomes cutanés et les caractéristiques de la peau. Dans cette étude, nous avons cherché à comprendre la relation entre les microbiomes cutanés et les caractéristiques de la peau en analysant des données complexes sur les microbiomes et la peau. MÉTHODES: Nous avons obtenu des données sur 19 caractéristiques de la peau et sur les microbiomes cutanés à partir de l'analyse du gène de l'ARNr 16S (16S rRNA) de 276 femmes japonaises en bonne santé. Nous avons ensuite effectué l'analyse en composantes principales (PCA: principal component analysis), une méthode qui prend en compte la structure de corrélation interne, sur 234 d'entre elles qui ne contenaient pas de valeurs aberrantes ou manquantes. Nous avons confirmé la relation entre les microbiomes cutanés et les caractéristiques de la peau à l'aide d'une analyse de régression en composantes principales et d'une analyse de regroupement hiérarchique (HCA: hierarchical clustering analysis). RÉSULTATS: L'analyse de régression en composantes principales a montré des relations fortes entre les microbiomes cutanés et les caractéristiques de la peau liées au sébum et au pH de la peau. Dans l'étude HCA, le panel de femmes a été classé en deux grands groupes sur la base du microbiome cutané. En outre, il y avait des différences significatives dans les caractéristiques de la peau liées au sébum et dans la façon dont l'état de la peau change avec l'âge entre ces groupes, ce qui suggère la possibilité de mesurer l'état de la peau et le risque cutané lié à l'âge à partir des données du microbiome. En outre, les caractéristiques liées au sébum différaient de manière significative chez les participants d'âge moyen, ce qui suggère une forte relation entre les microbiomes cutanés et les caractéristiques liées au sébum.L'analyse de l'état de la peau et du microbiome cutané chez les femmes japonaises, en tenant compte de la corrélation entre les variables, a montré que le microbiome cutané était significativement lié au nombre de pores et à la quantité de sébum. En outre, il a été suggéré que l'état de la peau et la façon dont l'état de la peau évolue avec le vieillissement peuvent différer en fonction du type de microbiome cutané. La découverte d'une relation entre l'état de la peau et le microbiome cutané suggère la possibilité de proposer à l'avenir une nouvelle méthode de beauté axée sur le microbiome cutané.
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