Uncovering the toxicological impact of benzo[a]pyrene on Alzheimer's disease via network toxicology, machine learning, and single-cell transcriptomics

疾病 生物标志物 计算生物学 生物 转录组 生物信息学 分子生物标志物 对接(动物) 胶质母细胞瘤 分子医学 文献计量学 生物标志物发现 基因表达谱 靶向治疗 精密医学 诊断生物标志物 医学 癌症 基因调控网络 基因 暴露的 基因组学
作者
Wencai Wang,XinYi Wei,Zhonghua Sun,Xuemei Zhang,Di Pan,Xiangxiang Hong,Xianfeng Li,Dan Yang
出处
期刊:Journal of Alzheimer's Disease [IOS Press]
卷期号:109 (3): 1220-1231 被引量:3
标识
DOI:10.1177/13872877251405468
摘要

BackgroundBenzo[a]pyrene (BaP), a common environmental neurotoxicant, has been linked to neurodegenerative diseases, yet its role in Alzheimer's disease (AD) remains unclear.ObjectiveThis study integrated network toxicology, machine learning, single-cell transcriptomics, and bibliometric analysis to explore BaP's mechanistic role in AD.MethodsA total of 253 BaP-AD common targets were identified and analyzed via GO/KEGG enrichment and PPI network construction. Key genes were screened using GEO-based AD differential expression data and machine learning (LASSO and SVM). Molecular docking assessed BaP-target interactions. Cell-type-specific expression was analyzed using single-cell RNA-seq (GSE157827). ROC curves evaluated diagnostic value, and bibliometrics explored research trends.ResultsTargets were enriched in oxidative stress and MAPK/PI3K-Akt pathways. EGFR and HSP90AB1 were identified as core targets, with strong BaP binding affinities (-8.4 and -11.7 kcal/mol, respectively). EGFR was highly expressed in astrocytes and OPCs; HSP90AB1 in astrocytes and neurons. EGFR had better diagnostic performance (AUC = 0.781). Bibliometric analysis showed increasing attention on EGFR's role in AD.ConclusionsBaP may promote AD by targeting EGFR and HSP90AB1, affecting inflammation, proteostasis, and survival pathways. Notably, EGFR may serve emerge a promising biomarker for early diagnosis and therapeutic intervention in AD. This study revealed the underlying molecular mechanisms linking environmental toxicants to AD pathogenesis.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
文艺颦完成签到,获得积分20
刚刚
banqia完成签到,获得积分10
刚刚
Ace完成签到,获得积分10
刚刚
苹果大福发布了新的文献求助20
1秒前
MaxTakeeeee发布了新的文献求助10
2秒前
2秒前
Winky完成签到 ,获得积分10
2秒前
wjf发布了新的文献求助10
2秒前
2秒前
Anonymous应助奶黄包采纳,获得20
3秒前
board_Gu完成签到,获得积分10
3秒前
Wtony完成签到 ,获得积分0
3秒前
3秒前
molihuakai应助飞飞采纳,获得10
3秒前
赘婿应助震南采纳,获得10
3秒前
狂野紫丝发布了新的文献求助10
3秒前
chentong完成签到 ,获得积分10
3秒前
4秒前
Aoren完成签到,获得积分10
4秒前
gcyyyds完成签到,获得积分10
4秒前
万能图书馆应助阳佟怀绿采纳,获得10
4秒前
yoyo完成签到,获得积分10
5秒前
5秒前
堇色完成签到,获得积分10
5秒前
好久不见发布了新的文献求助10
5秒前
Abi完成签到,获得积分10
5秒前
所所应助knock采纳,获得10
6秒前
顺利幻灵发布了新的文献求助10
6秒前
6秒前
6秒前
dd完成签到,获得积分20
6秒前
寂寞如松完成签到,获得积分10
7秒前
Lucas应助诗谙采纳,获得10
7秒前
Fanbio完成签到 ,获得积分10
7秒前
7秒前
边缘人发布了新的文献求助10
7秒前
7秒前
YF完成签到,获得积分10
7秒前
搜集达人应助友好大凄采纳,获得10
8秒前
fgghhh发布了新的文献求助10
8秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Principles of town planning: translating concepts to applications 1000
Navigating Normative Orders. Interdisciplinary Perspectives 800
1 Peter and Christ's Descent to the Dead in Its Early Christian Reception 700
Organizational Behavior 510
Management and the Arts 510
Matrix Methods in Data Mining and Pattern Recognition Second Edition 510
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 内科学 物理 复合材料 催化作用 细胞生物学 无机化学 光电子学 物理化学 电极 基因
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 7739343
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 9288296
关于积分的说明 20188719
捐赠科研通 7317489
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3306150
关于科研通互助平台的介绍 2458566
邀请新用户注册赠送积分活动 2316015