DRAMP 4.0: an open-access data repository dedicated to the clinical translation of antimicrobial peptides

生物 抗菌剂 抗菌肽 蛋白酶 细胞毒性 注释 计算生物学 生物信息学 微生物学 体外 生物化学
作者
T. Ma,Yanchao Liu,Bingxin Yu,Xin Sun,Hang‐Ping Yao,Hao Chen,Jianhui Li,Maryam Nawaz,Xun Jiang,Xingzhen Lao,Heng Zheng
出处
期刊:Nucleic Acids Research [Oxford University Press]
卷期号:53 (D1): D403-D410 被引量:1
标识
DOI:10.1093/nar/gkae1046
摘要

Antimicrobial peptides (AMPs) are potential candidates for treating multidrug-resistant bacterial infections, yet only a small number of them have progressed into clinical trials. The main challenges include the poor stability and hemolytic/cytotoxic properties of AMPs. Considering this, in the update of the Data Repository of Antimicrobial Peptides (DRAMP), a new annotation on serum and protease stability is added, and special efforts were made to update the hemolytic/cytotoxic information of AMPs. The DRAMP 4.0 currently holds 30 260 entries (8 001 newly added), consisting of 11 612 general entries, 17 886 patent entries, 96 clinical entries, 377 specific entries, 110 entries with stability data, and 179 expanded entries. A total of 2891 entries possess experimentally determined hemolytic activity information, while 2674 entries contain cytotoxicity data by experimental validation. The update also covers new annotations, statistics, categories, functions, and download links. DRAMP is available online at http://dramp.cpu-bioinfor.org/.
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